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Enregistrement W2891082052 · doi:10.23889/ijpds.v3i4.782

Using family physician Electronic Medical Record data to measure the pathways of cancer care

2018· article· en· W2891082052 sur OpenAlexaff
Liisa Jaakkimainen, Noah Crampton, Virgiliu Bogdan Pinzaru, Lisa DelGiudice, Karen Tu

Notice bibliographique

RevueInternational Journal for Population Data Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreInstitute for Clinical Evaluative Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBreast cancerLung cancerSpecialtyCancerMedical recordInternal medicineDiseaseOncologyFamily medicineIntensive care medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex


 IntroductionGaps in care have been identified along the disease pathway for specific cancers. However, no real-world data exists to identify wait times along these cancer pathways. Secondary use of family physician (FP) electronic medical record data (EMR) can augment existing health administrative data in measuring steps in the care pathways.
 Objectives and ApproachWe used FP EMR data to identify care pathways for lung cancer and breast cancer patients from the description of symptoms, to the initiation of investigations, referrals to specialty care and the receipt of specific treatments (surgery, chemotherapy, radiation treatment). Data from the Electronic Medical Record Administrative data Linked Database (EMRALD) held at the Institute for Clinical Evaluative Sciences (ICES) was used to identify a cohort of lung cancer and breast cancer patients. Data abstractors examined the FP EMR notes to identify pre-diagnostic symptoms, pre-diagnostic radiological test, biopsy results, oncology and surgical specialist referrals and post-diagnostic surgical and oncological consultations.
 ResultsTo date, abstractors have reviewed the FP EMR notes for 300 lung cancer patient and 1200 breast cancer patients. Abstractors identified an index date where there was documentation of the first abnormal test result and/or a FP progress note documenting a “suspicious” or “concerning” sign or symptom. For both lung cancer and breast cancer patients, a pre-diagnostic index date was identified in 88.5% of FP EMR notes. For lung cancer patients 66.7% based were based on abnormal chest x-rays and for breast cancer patients 81.1% were based on abnormal mammograms. Pre-diagnostic symptoms were identified in 62.1% of FP EMR notes and 81.6% had post-diagnostic consultation notes. Wait times from the index date to seeing an oncological specialist were less than four weeks for all patients.
 Conclusion/ImplicationsWe are able to use information from FP EMRs linked to health administrative data to identify pre-diagnostic care received by patients prior to their cancer diagnosis. This information can be used to identify care gaps and measure wait times in receiving cancer care from a patient’s perspective.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,823
Score d'incertitude au seuil0,590

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,179
Tête enseignante GPT0,445
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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