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Enregistrement W2891365275 · doi:10.1111/pbi.13012

Zinc finger nuclease‐mediated targeting of multiple transgenes to an endogenous soybean genomic locus via non‐homologous end joining

2018· article· en· W2891365275 sur OpenAlex
Nicholas D. Bonawitz, W. Michael Ainley, Asuka Itaya, Sivarama R. Chennareddy, Tobias Cicak, Katherine Effinger, Ke Jiang, Tejinder Mall, Pradeep Reddy Marri, J. Pon Samuel, Nagesh Sardesai, Matthew A. Simpson, Otto Folkerts, Rodrigo Sarria, Steven R. Webb, Delkin O. Gonzalez, Daina H. Simmonds, D. R. Pareddy

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePlant Biotechnology Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZinc finger nucleaseGenome editingBiologyCRISPRGeneticsGene targetingNon-homologous end joiningCas9TransgeneHomology directed repairZinc fingerLocus (genetics)NucleaseGeneGenome engineeringTranscription activator-like effector nucleaseHomologous recombinationComputational biologyDNA repairTranscription factorDNA mismatch repair

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Emerging genome editing technologies hold great promise for the improvement of agricultural crops. Several related genome editing methods currently in development utilize engineered, sequence‐specific endonucleases to generate DNA double strand breaks ( DSB s) at user‐specified genomic loci. These DSB s subsequently result in small insertions/deletions (indels), base substitutions or incorporation of exogenous donor sequences at the target site, depending on the application. Targeted mutagenesis in soybean ( Glycine max ) via non‐homologous end joining ( NHEJ )‐mediated repair of such DSB s has been previously demonstrated with multiple nucleases, as has homology‐directed repair ( HDR )‐mediated integration of a single transgene into target endogenous soybean loci using CRISPR /Cas9. Here we report targeted integration of multiple transgenes into a single soybean locus using a zinc finger nuclease ( ZFN ). First, we demonstrate targeted integration of biolistically delivered DNA via either HDR or NHEJ to the FATTY ACID DESATURASE 2‐1a ( FAD 2‐1a ) locus of embryogenic cells in tissue culture. We then describe ZFN ‐ and NHEJ ‐mediated, targeted integration of two different multigene donors to the FAD 2‐1a locus of immature embryos. The largest donor delivered was 16.2 kb, carried four transgenes, and was successfully transmitted to T 1 progeny of mature targeted plants obtained via somatic embryogenesis. The insertions in most plants with a targeted, 7.1 kb, NHEJ ‐integrated donor were perfect or near‐perfect, demonstrating that NHEJ is a viable alternative to HDR for gene targeting in soybean. Taken together, these results show that ZFN s can be used to generate fertile transgenic soybean plants with NHEJ ‐mediated targeted insertions of multigene donors at an endogenous genomic locus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,967

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle