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Enregistrement W2891451818 · doi:10.23889/ijpds.v3i4.824

Lessons learned: Linking patient-reported outcomes data with administrative databases

2018· article· en· W2891451818 sur OpenAlexaffabout
Laura Davis, Alyson Mahar, Lev D. Bubis, Qing Li, Haoyu Zhao, Lesley Moody, Rinku Sutradhar, Lisa Barbera, Natalie G. Coburn

Notice bibliographique

RevueInternational Journal for Population Data Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlobal Cancer Incidence and Screening
Établissements canadiensCancer Care OntarioInstitute for Clinical Evaluative SciencesSunnybrook Health Science CentreManitoba HealthHealth Sciences CentreSunnybrook Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineMedical recordData collectionCancerCohortPerspective (graphical)DiseaseMissing dataConversationCancer registryFamily medicineDatabasePsychologyInternal medicineComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

IntroductionSince 2007, Cancer Care Ontario (CCO) has systematically collected patient-reported outcomes (PROs) in the form of symptom data, for cancer outpatients visiting regional cancer centres or affiliate institutions. Data are used in real-time to facilitate conversation between clinicians and patients and have recently been combined with provincial administrative databases.
 Objectives and ApproachCCO collects PROs using the Edmonton Symptom Assessment System (ESAS), which scores 9 symptoms on a scale of 0 (no symptoms) to 10 (worst symptom severity). Data were imported from CCO in 2015 and linked to a cancer cohort at ICES. We investigated differences between patients who completed $\geq$1 ESAS record and patients who did not, as well as the number of records, timing of data collection and missingness. We describe our experience linking and using the PRO data to administrative data, including presenting trajectories of symptoms over time and combining scores into composite indices.
 Results120,745 cancer patients had 729,861 symptom records between 2007 and 2014. Not all patients with a cancer diagnosis had $\geq$1 ESAS record and this varied by patient, disease and system level factors. Because implementation occurred from a clinical perspective, data collection was irregular within and across patients and depended on treatment and other factors; the number of records per patient varied, as well the number of contributing patients in each time period following diagnosis. Attempts were made to create meaningful composite indices by combining all symptom scores as well as combining multiple high scores for each individual symptom. As a result, selecting the best statistical analysis to use these PRO data as an exposure or outcome is still uncertain.
 Conclusion/ImplicationsPRO data linked to provincial, administrative data holdings represent a new frontier for population-based cancer research, both in their challenging structure as well as their implications for clinical practice and health system. These lessons learned will hopefully support other researchers rigorous use of these data in the future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,134
Score d'incertitude au seuil0,388

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,004
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,526
Tête enseignante GPT0,548
Écart entre enseignants0,022 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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