Quantitative Analysis of the Brain Ubiquitylome in Alzheimer's Disease
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Several neurodegenerative diseases including Alzheimer's Disease (AD) are characterized by ubiquitin-positive pathological protein aggregates. Here, an immunoaffinity approach is utilized to enrich ubiquitylated isopeptides after trypsin digestion from five AD and five age-matched control postmortem brain tissues. Label-free MS-based proteomic analysis identifies 4291 unique ubiquitylation sites mapping to 1682 unique proteins. Differential enrichment analysis shows that over 800 ubiquitylation sites are significantly altered between AD and control cases. Of these, ≈80% are increased in AD, including seven poly ubiquitin linkages, which is consistent with proteolytic stress and high burden of ubiquitylated pathological aggregates in AD. The microtubule associated protein Tau, the core component of neurofibrillary tangles, has the highest number of increased sites of ubiquitylation per any protein in AD. Tau poly ubiquitylation from AD brain homogenates is confirmed by reciprocal co-immunoprecipitation and by affinity capture using tandem ubiquitin binding entities. Co-modified peptides, with both ubiquitylation and phosphorylation sites, are also enriched in AD. Notably, many of the co-modified peptides mapped to Tau within KXGS motifs in the microtubule binding region suggesting that crosstalk between phosphorylation and ubiquitylation occurs on Tau in AD. Overall, these findings highlight the utility of MS to map ubiquitylated substrates in human brain and provides insight into mechanisms underlying pathological protein posttranslational modification in AD.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle