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Enregistrement W2891505238 · doi:10.3389/fmicb.2018.01894

The Changing Face of Water: A Dynamic Reflection of Antibiotic Resistance Across Landscapes

2018· article· en· W2891505238 sur OpenAlexaff
Claire Sanderson, John Tyler Fox, Eric R. Dougherty, Andrew D. S. Cameron, Kathleen A. Alexander

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePharmaceutical and Antibiotic Environmental Impacts
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesMinistry of EnvironmentNational Science Foundation
Mots-clésDry seasonWater qualityEnvironmental scienceSurface waterWet seasonAgricultureHydrology (agriculture)Growing seasonAnimal scienceVeterinary medicineEcologyPhysical geographyGeographyBiologyEnvironmental engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Little is known about the role of surface water in the propagation of antibiotic resistance (AR), or the relationship between AR and water quality declines. While healthcare and agricultural sectors are considered the main contributors to AR dissemination, few studies have been conducted in their absence. Using linear models and Bayesian kriging, we evaluate AR among Escherichia coli water isolates collected bimonthly from the Chobe River in Northern Botswana (n=2062, n=414 water samples; July 2011- May 2012) in relation to water quality dynamics (E. coli, fecal coliform, and total suspended solids), land use, season, and AR in wildlife and humans within this system. No commercial agricultural or large medical facilities exist within this region. Here, we identify widespread AR in surface water, with land use and season significant predicators of AR levels. Mean AR was significantly higher in the wet season than the dry season (p = 0.003), and highest in the urban landscape (2.15, SD = 0.098) than the protected landscape (1.39, SD = 0.051). In-water E. coli concentrations were significantly positively associated with mean AR in the wet season (p<0.001) but not in the dry season (p=0.110), with TSS negatively associated with mean AR across seasons (p=0.016 and p=0.029), identifying temporal and spatial relationships between water quality variables and AR. Importantly, when human, water, and wildlife isolates were examined, similar AR profiles were identified (p<0.001). Our results suggest that direct human inputs are sufficient for extensive dispersal of AR into the environment, with landscape features, season and water quality variables influencing AR dynamics. Focused and expensive efforts to minimize pollution from agricultural sources, while important, may only provide incremental benefits to the management of AR across complex landscapes. Controlling direct human AR inputs into the environment remains a critical and pressing challenge.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,063

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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