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Enregistrement W2891516044 · doi:10.1038/s41437-018-0141-7

Is molecular evolution faster in the tropics?

2018· article· en· W2891516044 sur OpenAlexafffund
Matthew G. Orton, Jacqueline A. May, Winfield Ly, David J. Lee, Sarah J. Adamowicz

Notice bibliographique

RevueHeredity · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of GuelphSeneca Polytechnic
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of CanadaCanada First Research Excellence FundUniversity of Guelph
Mots-clésBiologyLineage (genetic)Evolutionary biologyLatitudeCladeMolecular evolutionEcologyDNA barcodingPhylogeneticsZoologyInvertebrateGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The evolutionary speed hypothesis (ESH) suggests that molecular evolutionary rates are higher among species inhabiting warmer environments. Previously, the ESH has been investigated using small numbers of latitudinally-separated sister lineages; in animals, these studies typically focused on subsets of Chordata and yielded mixed support for the ESH. This study analyzed public DNA barcode sequences from the cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene for six of the largest animal phyla (Arthropoda, Chordata, Mollusca, Annelida, Echinodermata, and Cnidaria) and paired latitudinally-separated taxa together informatically. Of 8037 lineage pairs, just over half (51.6%) displayed a higher molecular rate in the lineage inhabiting latitudes closer to the equator, while the remainder (48.4%) displayed a higher rate in the higher-latitude lineage. To date, this study represents the most comprehensive analysis of latitude-related molecular rate differences across animals. While a statistically-significant pattern was detected from our large sample size, our findings suggest that the EHS may not serve as a strong universal mechanism underlying the latitudinal diversity gradient and that COI molecular clocks may generally be applied across latitudes. This study also highlights the merits of using automation to analyze large DNA barcode datasets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,312
Score d'incertitude au seuil0,171

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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