Pharmacogenomics of vincristine‐induced neurotoxicity in pediatric cancer patients
Notice bibliographique
Résumé
The use of the anticancer agent vincristine is limited by debilitating neurotoxicity (VIN), for which a genetic basis has been suggested. Here, we investigated variation in 315 genes involved in drug absorption, metabolism, distribution, excretion (ADME) and toxicity in the context of VIN in children with cancer. We genotyped 4536 ADME variants in a pilot cohort of 140 children with Wilms tumor and rhabdomyosarcoma. To replicate findings, known variants in CYP3A5 and ABCB1 as well as variants with evidence for association (p<0.01) in the pilot cohort were analyzed in 422 patients with acute lymphoblastic leukemia (ALL). No association of variants in CYP3A5 or ABCB1 with VIN was observed. Of the candidates identified in the pilot cohort, the association of a variant in ABCA4 with VIN was replicated in patients with ALL (combined cohort OR: 1.7; P = 2.9×10 −4 ). This study was the first to broadly screen genetic variation in the context of VIN in pediatric cancer patients and serves as a starting point for further study of the genetic basis of VIN, providing novel hypotheses for mechanisms underlying the susceptibility to VIN and the possibility for predictive genetic testing to identify patients at risk. Funded by CIHR/CFI
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».