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Enregistrement W2891855634 · doi:10.1177/0300985818798121

Observational Study Design in Veterinary Pathology, Part 2: Methodology

2018· article· en· W2891855634 sur OpenAlexafffund
Jeff Caswell, Laura Bassel, Jamie L. Rothenburger, Andrea Gröne, Jan M. Sargeant, Amanda P. Beck, Stina Ekman, Katherine N. Gibson‐Corley, Thijs Kuiken, Elise E. B. LaDouceur, David K. Meyerholz, Francesco C. Origgi, Horst Posthaus, Simon L. Priestnall, Lorenzo Ressel, Leslie C. Sharkey, Leandro B. C. Teixeira, Kazuyuki Uchida, Jerrold M. Ward, Joshua D. Webster, Jyoji Yamate

Notice bibliographique

RevueVeterinary Pathology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésObservational studyBlindingPathologyMedicineGrading (engineering)PopulationMedical physicsEnvironmental healthBiologyRandomized controlled trial

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Observational studies are a basis for much of our knowledge of veterinary pathology, yet considerations for conducting pathology-based observational studies are not readily available. In part 1 of this series, we offered advice on planning and carrying out an observational study. Part 2 of the series focuses on methodology. Our general recommendations are to consider using already-validated methods, published guidelines, data from primary sources, and quantitative analyses. We discuss 3 common methods in pathology research-histopathologic scoring, immunohistochemistry, and polymerase chain reaction-to illustrate principles of method validation. Some aspects of quality control include use of clear objective grading criteria, validation of key reagents, assessing sample quality, determining specificity and sensitivity, use of technical and biologic negative and positive controls, blinding of investigators, approaches to minimizing operator-dependent variation, measuring technical variation, and consistency in analysis of the different study groups. We close by discussing approaches to increasing the rigor of observational studies by corroborating results with complementary methods, using sufficiently large numbers of study subjects, consideration of the data in light of similar published studies, replicating the results in a second study population, and critical analysis of the study findings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,322
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,325
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,678
Score d'incertitude au seuil0,836

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3220,325
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0030,006
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,436
Tête enseignante GPT0,429
Écart entre enseignants0,007 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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