WINTHER: An international study to select rational therapeutics based on the analysis of matched tumor and normal biopsies in subjects with advanced malignancies.
Notice bibliographique
Résumé
TPS11625 Background: Today, personalized cancer medicine implies matching the patient’s tumor genomic characteristics with molecularly and immune targeted agents. Although there are an increasing number of DNA aberrations that can now be matched to a cognate therapy, some patients do not display such druggable oncogene drivers. Methods: WINTHER is an open non-randomized study involving 6 cancer centers in France, Spain, Israel, Canada and USA applying genomic and also transcriptomic assays to guide treatment decisions. The novelty of the WINTHER approach lies in the use of tumor and matched normal tissue biopsies together and an algorithm for predicting efficacy of therapies. The aim is to provide a rational therapeutic choice for all of the patients enrolled in the study whether or not they harbor actionable DNA alterations. The study endpoint is the comparison of the progression-free-survival (PFS) under the WINTHER selected therapy to the PFS of the last therapeutic line. Patients included have refractory metastatic cancer of any histological type, with at least one prior therapeutic regimen and performance status of 0 to 1. Patients who have received a matched treatment based on a molecular anomaly as their immediate prior therapy were excluded. After consent, patients undergo a tumor and histologically-matched normal tissue biopsy. Extracted DNA and RNA of both tumor and normal from frozen tissues at the local center under common standard operating procedures are sent to centralized laboratories for omics investigations. DNA is investigated at Foundation Medicine Inc. and RNA at Gustave Roussy using Agilent technology. For RNA, the WINTHER algorithm is applied on the differential RNA expression data between tumor and normal tissues and establishes the list of drugs with the presumed higher score of efficacy for each patient. Patients with actionable genomic events enter in ARM A, and patients without any druggable anomaly of the DNA enter in ARM B and are treated using the WINTHER algorithm RNA-based treatment decision tool. To date, the trial has recruited 303 patients. Clinical trial information: NCT01856296.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».