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Enregistrement W2891953286 · doi:10.1371/journal.pgen.1007660

FGF-induced Pea3 transcription factors program the genetic landscape for cell fate determination

2018· article· en· W2891953286 sur OpenAlexfundno aff
Ankur Garg, Abdul Hannan, Qian Wang, Tamica N. Collins, Siying Teng, Mukesh Bansal, Jian Zhong, Keli Xu, Xin Zhang

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Eye InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaResearch to Prevent BlindnessNational Institute on AgingNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyCell fate determinationTranscription factorLacrimal glandNotch signaling pathwayFibroblast growth factorGeneCell biologyGeneticsPathologyReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

FGF signaling is a potent inducer of lacrimal gland development in the eye, capable of transforming the corneal epithelium into glandular tissues. Here, we show that genetic ablation of the Pea3 family of transcription factors not only disrupted the ductal elongation and branching of the lacrimal gland, but also biased the lacrimal gland epithelium toward an epidermal cell fate. Analysis of high-throughput gene expression and chromatin immunoprecipitation data revealed that the Pea3 genes directly control both the positive and negative feedback loops of FGF signaling. Importantly, Pea3 genes are also required to suppress aberrant Notch signaling which, if gone unchecked, can compromise lacrimal gland development by preventing the expression of both Sox and Six family genes. These results demonstrate that Pea3 genes are key FGF early response transcriptional factors, programing the genetic landscape for cell fate determination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,501

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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