FGF-induced Pea3 transcription factors program the genetic landscape for cell fate determination
Notice bibliographique
Résumé
FGF signaling is a potent inducer of lacrimal gland development in the eye, capable of transforming the corneal epithelium into glandular tissues.Here, we show that genetic ablation of the Pea3 family of transcription factors not only disrupted the ductal elongation and branching of the lacrimal gland, but also biased the lacrimal gland epithelium toward an epidermal cell fate.Analysis of high-throughput gene expression and chromatin immunoprecipitation data revealed that the Pea3 genes directly control both the positive and negative feedback loops of FGF signaling.Importantly, Pea3 genes are also required to suppress aberrant Notch signaling which, if gone unchecked, can compromise lacrimal gland development by preventing the expression of both Sox and Six family genes.These results demonstrate that Pea3 genes are key FGF early response transcriptional factors, programing the genetic landscape for cell fate determination. Author summaryFGF signaling regulates cell fate decision by inducing genome-wide changes in gene expression.We identified Pea3 family transcription factors as the key effectors of FGF signaling in reprograming the epithelia transcriptome.Pea3 factors control both the feedback and feedforward circuities of FGF signaling in lacrimal gland development.They also activate specific expression of Six and Sox family genes and suppress aberrant activation of Notch signaling.In the absence of Pea3 genes, the lacrimal gland progenitors become epidermal-like in their gene expression patterns.The study of Pea3 function resolves the long standing conundrum of how FGF induces the lacrimal gland fate, providing direction for regenerating the lacrimal gland to treat dry eye diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».