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Enregistrement W2892005623 · doi:10.1139/cjfr-2018-0347

Isolation and identification of endophytic diazotrophs from lodgepole pine trees growing at unreclaimed gravel mining pits in central interior British Columbia, Canada

2018· article· en· W2892005623 sur OpenAlexafffundvenueabout
Kiran Preet Padda, Akshit Puri, Chris P. Chanway

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Forest Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésDiazotrophPinus contortaNitrogen fixationBiologyBotanyPaenibacillus polymyxaEndophyteNitrogenaseBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Unreclaimed gravel mining pits located in the central interior of British Columbia have very limited soil nitrogen (N) levels due to gravelly textured soils with weak profile development, no organic forest floor, and low atmospheric N inputs through precipitation. However, lodgepole pine (Pinus contorta var. latifolia Engelm. ex S. Watson) trees can be found growing well at these pits with tissue N content and growth rate unaffected by extremely low soil N levels, indicating that pine trees are able to meet their N requirements from an unknown source. We hypothesized that biological N fixation by bacteria living in the tree tissues (known as endophytic diazotrophs) could be a potential N source for these trees. To test this hypothesis, we isolated 77 potential endophytic diazotrophs from needle, stem, and root tissues of pine trees on N-free culture medium. Of these, 32 bacteria showed positive N-fixing ability when tested for nitrogenase enzyme activity using the acetylene reduction assay. These endophytic N-fixing bacteria were identified as mainly belonging to the genera Pseudomonas, Bacillus, Paenibacillus, and Rhizobium, which are well known for their plant-beneficial traits including N fixation. Therefore, it can be concluded that pine trees growing at these severely N-limited gravel pits naturally harbour endophytic diazotrophs, which could be involved in sustaining their vigorous growth, possibly through biological N fixation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,359
Score d'incertitude au seuil0,721

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2018
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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