Abstract B065: Genomic analysis of localized prostate cancer identifies AZIN1 as driver of metastatic progression
Notice bibliographique
Résumé
Abstract High-risk PCa (HRPCa) remains very heterogeneous with an unacceptable variation in patient outcome after radical prostatectomy, with cancer-specific mortality rates ranging from 4.6% to 20.3% at 10 years’ follow-up. Clearly, we need a better understanding of the tumor biology to enhance the subclassification, enable the identification of lethal PCa, and eventually allow a more precise decision-making regarding treatment. We created a matched case-control study of two clinically identical HRPCa patient groups, both treated with radical prostatectomy but where one developed metastatic recurrence (n=19) and the other did not (n=25), despite very-long-term follow-up. The integrated analysis of copy number aberrations and transcriptome analysis highlighted a focal amplification of 8q22.3 in the metastatic group, associated with a higher expression of antizyme inhibitor 1 (AZIN1) in our cohort. This association of high AZIN1 levels with the metastatic HRPCa phenotype suggests a role for AZIN1 as possible predictor and/or target for metastatic HRPCa. AZIN1 is one of the regulators of the polyamine synthesis, which play a central role in many cellular processes. Our in vitro analyses confirmed that modulation of AZIN1 expression determines both growth and migratory potential of prostate cancer cells. Future experiments are planned to confirm these data in the in vivo setting. RNA sequencing after knockdown of AZIN1 in PCa cells revealed several transcriptional programs that are activated/deactivated upon AZIN1 knockdown. This showed among others a significant upregulation of genes involved in extracellular matrix composition, including genes encoding for subunits of the collagen IV, which is an integral part of the basement membrane. Ongoing experiments focus on identifying the mechanism by which AZIN1 regulates collagen IV expression. Citation Format: Thomas Van den Broeck, Lisa Moris, Thomas Gevaert, Elien Smeets, Stefan Prekovic, Christine Helsen, Hendrik van Poppel, Wouter Everaerts, Christine Buerki, Elai Davicioni, Steven Joniau, Frank Claessens. Genomic analysis of localized prostate cancer identifies AZIN1 as driver of metastatic progression [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference: Prostate Cancer: Advances in Basic, Translational, and Clinical Research; 2017 Dec 2-5; Orlando, Florida. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(16 Suppl):Abstract nr B065.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».