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Enregistrement W2892099024 · doi:10.1139/cjm-2018-0350

Characterization and sequence analysis of potential biofertilizer and biocontrol agent <i>Bacillus subtilis</i> strain SEM-9 from silkworm excrement

2018· article· en· W2892099024 sur OpenAlexvenueno aff
Qingrong Li, Sentai Liao, Huyu Zhi, Dongxu Xing, Yang Xiao, Qiong Yang

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSurfactinBiologyFusarium oxysporumFusarium wiltBacillus subtilisBiological pest controlFusariumMicrobiologyStrain (injury)Bacillus amyloliquefaciensBiofertilizerWilt diseaseHorticultureFood scienceBacteriaFermentationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fusarium wilt is a devastating soil-borne disease caused mainly by highly host-specific formae speciales of Fusarium oxysporum. Antagonistic microorganisms play a very important role in Fusarium wilt control, and the isolation of potential biocontrol strains is becoming more and more important. We isolated a bacterial strain (SEM-9) from the high-temperature stage of silkworm excrement composting, which had a marked ability to solubilize phosphorus, promote the growth and increase the yield of the small Chinese cabbage, and which also exhibited considerable antagonistic effect towards Fusarium sambucinum and other fungi. The result of physiological and biochemical analyses, as well as genome sequencing, showed that SEM-9 was a strain of Bacillus subtilis. Through genome annotation and analysis, it was found that SEM-9 contained genes related to the regulation of biofilm formation, which may play an important role in colonization, and gene clusters encoding the biosynthesis of antimicrobials, such as surfactin, bacilysin, fengycin, and subtilosin-A. The production of such antifungal compounds may constitute the basis of the mode-of-action of SEM-9 against Fusarium spp. These data suggested that the SEM-9 strain has potential as both a biofertilizer and a biocontrol agent, with the potential to manage Fusarium wilt disease in crops.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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