Linking lab, program, and administrative data to provide comprehensive colorectal cancer screening status of patients to primary care providers in Calgary, Alberta
Notice bibliographique
Résumé
IntroductionColorectal cancer (CRC) screening is associated with significant reductions in burden, mortality and cost. Primary care providers in Alberta do not have access to integrated CRC testing histories for patients. Providing this information will support CRC screening among patients at average and high risk, follow-up of abnormal tests, and surveillance. Objectives and ApproachCalgary Laboratory Services, Colon Cancer Screening Centre, Alberta Cancer Registry, and endoscopy data were linked to create a comprehensive CRC screening history at the patient level. Based on screening histories and the current Clinical Practice Guideline, an algorithm was created to determine CRC screening statuses with the aim of providing accurate screening rates when linked to primary care provider patient panels. Results from the linkage are designed to be incorporated into clinic and EMR workflow processes to support adherence to evidence-based screening recommendations at the point of care. ResultsA comprehensive assessment of screening status was determined by integrating Fecal Immunochemical Test (FIT) and colonoscopy data. Among a sample cohort, patients were identified as being due for screening with FIT, requiring follow-up for a positive FIT test, or requiring appropriate surveillance for a positive-screen or abnormal colonoscopy findings. A summary report, actionable list, and resources were developed to convey findings. The summary report displayed CRC screening rates for a provider’s panel. The actionable list provided CRC screening statuses for each patient aged 40 to 84 indicating patients due for screening with FIT, for follow-up of positive FIT, or for surveillance colonoscopy. The resources were developed to support quality improvement for colorectal cancer screening for patients. Conclusion/ImplicationsThe data linkages and algorithm provide comprehensive CRC screening, follow-up, and surveillance information that could support guideline-adherent screening, increase screening rates, reduce duplication or unnecessary testing, and provide primary care providers with timely and robust information to support clinical decisions for individuals inside and outside of the target screening population.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».