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Enregistrement W2892201326 · doi:10.1101/412072

Three-dimensional tissue stiffness mapping in the mouse embryo supports durotaxis during early limb bud morphogenesis

2018· preprint· en· W2892201326 sur OpenAlexafffund
Min Zhu, Hirotaka Tao, Mohammad Samani, Mengxi Luo, Xian Wang, Sevan Hopyan, Yu Sun

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésMorphogenesisStiffnessBiologyLimb budCell biologyFibronectinMechanobiologyEmbryoAnatomyMaterials scienceExtracellular matrixGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Numerous biophysical hypotheses invoke tissue stiffness as a key parameter for shaping tissue during development and for influencing cell behaviours during disease progression. However, currently available methods are insufficient to test hypotheses that concern the physical properties of bulk tissues. Here we introduce, validate and apply a new 3D magnetic device that generates a uniform magnetic field gradient within a space that is sufficient to accommodate a vertebrate, organ-stage embryo under live conditions. The device allows for rapid, nontoxic measurement of the spatial variation of absolute elastic modulus and viscosity deep within mesenchymal tissues and within epithelia. By applying the device to map the spatiotemporal variation of viscoelastic properties within the early mouse limb bud, we identified an anteriorly biased mesodermal stiffness gradient along which cells move collectively to shape the early bud. Tissue stiffness corresponds to the nascent expression domain of fibronectin that is Wnt5a -dependent. The findings challenge the notion that Wnt5a regulates cell movements by chemotaxis, and raises the possibility that Wnt5a modifies the tissue microenvironment to promote durotaxis in vivo . Importantly, the ability to precisely measure tissue stiffness in 3D has the potential to instigate and refine mechanisms of development and disease progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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