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Enregistrement W2892282588 · doi:10.1016/j.ccell.2018.08.002

Aberrant ERBB4-SRC Signaling as a Hallmark of Group 4 Medulloblastoma Revealed by Integrative Phosphoproteomic Profiling

2018· article· en· W2892282588 sur OpenAlexafffund
Antoine Forget, Loredana Martignetti, Stéphanie Puget, Laurence Calzone, Sebastian Brabetz, Daniel Picard, Arnau Montagud, Stéphane Liva, Alexandre Sta, Florent Dingli, Guillaume Arras, Jaime A. Rivera, Damarys Loew, Aurore Besnard, Joëlle Lacombe, Mélanie Pagès, Pascale Varlet, Christelle Dufour, Hua Yu, Audrey Mercier, Émilie Indersie, Anaïs Chivet, Sophie Leboucher, Laura Sieber, Kévin Beccaria, Michael Gombert, Frauke Meyer, Nan Qin, Jasmin Bartl, Lukas Chávez, Konstantin Okonechnikov, Tanvi Sharma, Venu Thatikonda, Franck Bourdeaut, Célio Pouponnot, Vijay Ramaswamy, Andrey Korshunov, Arndt Borkhardt, Guido Reifenberger, Patrick Poullet, Michael D. Taylor, Marcel Kool, Stefan M. Pfister, Daisuke Kawauchi, Emmanuel Barillot, Marc Remke, Olivier Ayrault

Notice bibliographique

RevueCancer Cell · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesInstitut CurieHospital for Sick ChildrenCentre National de la Recherche ScientifiqueFondation de FranceFondation ARC pour la Recherche sur le CancerDeutsche ForschungsgemeinschaftKoning BoudewijnstichtingDeutsches KrebsforschungszentrumPediatric Brain Tumor FoundationConseil National de la Recherche ScientifiqueFondation pour la Recherche MédicaleKing Baudouin Foundation United States
Mots-clésMedulloblastomaBiologyKinomeProteomicsProteogenomicsHedgehogSignal transductionTranscriptomeProteomeHedgehog signaling pathwayProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcCancer researchPhosphoproteomicsComputational biologyCell biologyPhosphorylationBioinformaticsGeneticsGeneGene expressionProtein phosphorylationProtein kinase A

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations137
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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