The Proteome Response of Salt-Sensitive Rapeseed (Brassica napus L.) Genotype to Salt Stress
Notice bibliographique
Résumé
Productivity of rapeseed (Brassica napus L.), the third most important oilseed crop, was reduced more than other crops under the salt stress higher than the threshold. Thus, breeding, especially at seedling stage, seems necessary. Plants under salt stress, by synthesis of essential metabolites, specific structural proteins or enzymes of metabolic pathways deal with the stress. To identify the molecular mechanisms of salt responsiveness in rapeseed, ‘Option500’ a salt-sensitive genotype was exposed to 0, 150, and 300mM NaCl during the seedling stage. An increase in proline and the Na+ content of leaf and a reduction in shoot dry weight, plant height, K+ content and K+/Na+ ratio were observed. Protein expression changes were examined by two-dimensional electrophoresis (2-DE). Out of 110 protein spots identified by 2-DE gels, 37 spots showed significant abundant changes based on induction factor (IF), and 7 spots were recognized significantly at 5% probability level, which 1 and 6 spots were up and down-regulated, respectively. By using LC-MS/MS mass spectrometry analysis, proteins were identified which are involved in energy production and photosynthesis. Activity of enzymes involved in energy production decreased under stress, while the abundance of Phosphoribulokinase (PRK) -an important enzyme in the pentose phosphate pathway- increased.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».