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Enregistrement W2892872231 · doi:10.15835/nbha47111133

The Proteome Response of Salt-Sensitive Rapeseed (Brassica napus L.) Genotype to Salt Stress

2018· article· en· W2892872231 sur OpenAlexfundno aff
Nima Dolatabadi, Mahmoud Toorchi, Mostafa Valizadeh, Ali Bandehagh

Notice bibliographique

RevueNotulae Botanicae Horti Agrobotanici Cluj-Napoca · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced Proteomics Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Alberta
Mots-clésRapeseedSeedlingBrassicaSpotsProlineProteomeShootHorticultureBiologyFood scienceEnzymeDry weightChemistryEnzyme assayBotanyAgronomyBiochemistryAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Productivity of rapeseed (Brassica napus L.), the third most important oilseed crop, was reduced more than other crops under the salt stress higher than the threshold. Thus, breeding, especially at seedling stage, seems necessary. Plants under salt stress, by synthesis of essential metabolites, specific structural proteins or enzymes of metabolic pathways deal with the stress. To identify the molecular mechanisms of salt responsiveness in rapeseed, ‘Option500’ a salt-sensitive genotype was exposed to 0, 150, and 300mM NaCl during the seedling stage. An increase in proline and the Na+ content of leaf and a reduction in shoot dry weight, plant height, K+ content and K+/Na+ ratio were observed. Protein expression changes were examined by two-dimensional electrophoresis (2-DE). Out of 110 protein spots identified by 2-DE gels, 37 spots showed significant abundant changes based on induction factor (IF), and 7 spots were recognized significantly at 5% probability level, which 1 and 6 spots were up and down-regulated, respectively. By using LC-MS/MS mass spectrometry analysis, proteins were identified which are involved in energy production and photosynthesis. Activity of enzymes involved in energy production decreased under stress, while the abundance of Phosphoribulokinase (PRK) -an important enzyme in the pentose phosphate pathway- increased.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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