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Enregistrement W2892907391 · doi:10.1111/1462-2920.14428

Functional CTR‐type Cu(I) transporters in an oceanic diatom

2018· article· en· W2892907391 sur OpenAlexafffund
Liangliang Kong, Neil M. Price

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueChromium effects and bioremediation
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésBiologyDiatomTransporterAcclimatizationTranscriptomeCopperBiochemistryGeneBotanyGene expressionChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Copper concentration is so low in some remote parts of the sea it limits phytoplankton growth, but may be high enough in coastal and estuarine regions to be toxic. Acclimation to variations in Cu concentration thus requires a tightly regulated Cu transport system to help maintain Cu homeostasis. In marine species, the molecular mechanisms of Cu transport are not known. We studied Cu‐responsive genes and uptake in Thalassiosira oceanica at environmentally relevant Cu concentrations varying between 0.012 and 12 900 pmol Cu′ l −1 . Copper uptake rate assessed at high Cu concentration was three‐fold faster in Cu‐limited than in Cu‐replete cells, confirming the existence of an inducible uptake pathway in this diatom. Four putative CTR‐type Cu transporters ( To CTR1, To CTR2, To CTR3a and To CTR3b) identified in the transcriptome shared conserved features with known high‐affinity Cu(I) transporters. Expression of the CTR genes was upregulated as Cu concentration declined and cells maintained maximum rates of growth. Further decreases in Cu led to decreased growth rate and increased abundance of To CTR3a/b. Both To CTR3a and 3b restored growth of a Cu transport mutant, Saccharomyces cerevisiae ctr1Δctr3Δ , in Cu‐deficient medium and increased the uptake rates of Cu(I) and Cu(II). Thus, To CTR3a/3b is a high‐affinity Cu(I) transporter that, in conjunction with the other To CTRs, may enable T. oceanica to survive in Cu‐deplete ocean environments and respond to natural variation in Cu availability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,692
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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