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Enregistrement W2893499847 · doi:10.1038/s41467-018-06573-8

Molecular architecture and regulation of BCL10-MALT1 filaments

2018· article· en· W2893499847 sur OpenAlexaff
Florian Schlauderer, Thomas Seeholzer, Ambroise Desfosses, Torben Gehring, Mike Strauss, Karl‐Peter Hopfner, Irina Gutsche, Daniel Krappmann, Katja Lammens

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesFrench Infrastructure for Integrated Structural BiologyCentre National de la Recherche ScientifiqueAgence Nationale de la RechercheLeibniz-GemeinschaftDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésBCL10Jurkat cellsCoiled coilCell biologyBiologyComputational biologyImmune systemGeneticsT cellGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The CARD11-BCL10-MALT1 (CBM) complex triggers the adaptive immune response in lymphocytes and lymphoma cells. CARD11/CARMA1 acts as a molecular seed inducing BCL10 filaments, but the integration of MALT1 and the assembly of a functional CBM complex has remained elusive. Using cryo-EM we solved the helical structure of the BCL10-MALT1 filament. The structural model of the filament core solved at 4.9 Å resolution identified the interface between the N-terminal MALT1 DD and the BCL10 caspase recruitment domain. The C-terminal MALT1 Ig and paracaspase domains protrude from this core to orchestrate binding of mediators and substrates at the filament periphery. Mutagenesis studies support the importance of the identified BCL10-MALT1 interface for CBM complex assembly, MALT1 protease activation and NF-κB signaling in Jurkat and primary CD4 T-cells. Collectively, we present a model for the assembly and architecture of the CBM signaling complex and how it functions as a signaling hub in T-lymphocytes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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