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Enregistrement W2893546427 · doi:10.1002/hipo.23036

Immediate‐early gene <i>Homer1a</i> intranuclear transcription focus intensity as a measure of relative neural activation

2018· article· en· W2893546427 sur OpenAlexafffund
Wing Kar Li Witharana, Benjamin J. Clark, Vivek Trivedi, Lilia Mesina, Bruce L. McNaughton

Notice bibliographique

RevueHippocampus · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neuropharmacology Research
Établissements canadiensUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesAlberta InnovatesCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Innovates - Health SolutionsNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésHippocampal formationPopulationTranscription (linguistics)NeuroscienceImmediate early geneNucleusChemistryBiologyGeneGene expressionMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Immediate‐early genes (IEGs) exhibit a rapid, transient transcription response to neuronal activation. Fluorescently labeled mRNA transcripts appear as bright intranuclear transcription foci (INF), which have been used as an all‐or‐nothing indicator of recent neuronal activity; however, it would be useful to know whether INF fluorescence can be used effectively to assess relative activations within a neural population. We quantified the Homer1a ( H1a ) response of hippocampal neurons to systematically varied numbers of exposures to the same places by inducing male Long‐Evans rats to run laps around a track. Previous studies reveal relatively stable firing rates across laps on a familiar track. A strong linear trend ( r 2 &gt; 0.9) in INF intensity was observed between 1 and 25 laps, after which INF intensity declined as a consequence of dispersion related to the greater elapsed time. When the integrated fluorescence of the entire nucleus was considered instead, the linear relationship extended to 50 laps. However, there was only an approximate doubling of H1a detected for this 50‐fold variation in total spiking. Thus, the intranuclear H1a RNA fluorescent signal does provide a relative measure of how many times a set of neurons was activated over a ~10 min period, but the dynamic range and hence signal‐to‐noise ratios are poor. This low dynamic range may reflect previously reported reductions in the IEG response during repeated episodes of behavior over longer time scales. It remains to be determined how well the H1a signal reflects relative firing rates within a population of neurons in response to a single, discrete behavioral event.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,792

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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