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Enregistrement W2893601964 · doi:10.1080/14620316.2018.1523693

Cloning and <i>in silico</i> and expression analyses of the heterotrimeric G protein α subunit gene (<i>EjLGA1</i>) from loquat (<i>Eriobotrya japonica</i>) fruits under cold storage with different pretreatments

2018· article· en· W2893601964 sur OpenAlexaff
Ti Wu, Shoukai Lin, Bisha Wu, Yu Chen, Suying Lin, Dahe Lin, Linxia Chen, Zhisheng Zhang, Jincheng Wu

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Horticultural Science and Biotechnology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Fujian Province
Mots-clésEriobotryaCloning (programming)Heterotrimeric G proteinJaponicaGeneIn silicoBiologyProtein subunitGene expressionGeneticsBotanyG proteinComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cold-stored fruits of the loquat (Eriobotrya japonica Lindl.) plant suffer from strong lignification, which leads to a hard texture and a crude mouthfeel of the pulp. However, the signalling mechanisms of loquat fruits under cold storage remain unclear. In this study, the heterotrimeric G protein α subunit (Gα) gene (EjLGA1) from loquat was isolated, and in silico analysis was performed. The levels of EjLGA1 expression in cold-stored loquat fruits with different pretreatments were also investigated. The largest open-reading frame of EjLGA1 is 1173 bp, encoding a polypeptide of 390 amino acids. The nucleotide and amino acid sequences of the Gα subunit are highly conserved among loquat and 48 other seed plants, indicating that the loquat Gα subunit likely has similar functions in other plants. A reliable model of the loquat Gα subunit was constructed, which revealed the structure of the subunit. Quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction (qRT-PCR) results showed that EjLGA1 is highly expressed under cold storage, which suggests the significance of EjLGA1 function in loquat fruits in response to cold stress. However, ethephon and 1-methylcyclopropene (1-MCP) pretreatments did not regulate EjLGA1expression. These results provide new insight into the signalling mechanism in cold-stored loquat fruits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,587

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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