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Enregistrement W2894090008 · doi:10.1016/j.joca.2018.09.009

3D morphometric analysis of calcified cartilage properties using micro-computed tomography

2018· article· en· W2894090008 sur OpenAlexaff
Sami Kauppinen, Sakari S. Karhula, Jérôme Thevenot, Tuomo Ylitalo, Lassi Rieppo, I. Kestilä, Marianne Haapea, I. Hadjab, Mikko Finnilä, É. Quenneville, M. Garon, Harpal K. Gahunia, Kenneth P. H. Pritzker, Michael D. Buschmann, Simo Saarakkala, Heikki J. Nieminen

Notice bibliographique

RevueOsteoarthritis and Cartilage · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOsteoarthritis Treatment and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai HospitalPolytechnique MontréalMichelin (Canada)Biomomentum (Canada)
Organismes subventionnairesSeventh Framework ProgrammeSigrid Juséliuksen SäätiöEuropean Research CouncilOulun YliopistoAcademy of FinlandEuropean Commission
Mots-clésOsteoarthritisSubchondral boneMedicineNuclear medicineComputed tomographyX-ray microtomographyGrading (engineering)ReproducibilityTomographyBiomedical engineeringArticular cartilagePathologyRadiologyChemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective Our aim is to establish methods for quantifying morphometric properties of calcified cartilage (CC) from micro-computed tomography (μCT). Furthermore, we evaluated the feasibility of these methods in investigating relationships between osteoarthritis (OA), tidemark surface morphology and open subchondral channels (OSCCs). Method Samples ( n = 15) used in this study were harvested from human lateral tibial plateau ( n = 8). Conventional roughness and parameters assessing local 3-dimensional (3D) surface variations were used to quantify the surface morphology of the CC. Subchondral channel properties (percentage, density, size) were also calculated. As a reference, histological sections were evaluated using Histopathological osteoarthritis grading (OARSI) and thickness of CC and subchondral bone (SCB) was quantified. Results OARSI grade correlated with a decrease in local 3D variations of the tidemark surface (amount of different surface patterns ( r s = −0.600, P = 0.018), entropy of patterns (EP) ( r s = −0.648, P = 0.018), homogeneity index (HI) ( r s = 0.555, P = 0.032)) and tidemark roughness (TMR) ( r s = −0.579, P = 0.024). Amount of different patterns (ADP) and EP associated with channel area fraction (CAF) ( r p = 0.876, P < 0.0001; r p = 0.665, P = 0.007, respectively) and channel density (CD) ( r p = 0.680, P = 0.011; r p = 0.582, P = 0.023, respectively). TMR was associated with CAF ( r p = 0.926, P < 0.0001) and average channel size ( r p = 0.574, P = 0.025). CC topography differed statistically significantly in early OA vs healthy samples. Conclusion We introduced a μ-CT image method to quantify 3D CC topography and perforations through CC. CC topography was associated with OARSI grade and OSCC properties; this suggests that the established methods can detect topographical changes in tidemark and CC perforations associated with OA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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