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Enregistrement W2894095027 · doi:10.1155/2018/8238459

How Supraphysiological Oxygen Levels in Standard Cell Culture Affect Oxygen‐Consuming Reactions

2018· review· en· W2894095027 sur OpenAlexaff
Jeffrey A. Stuart, João Fonseca, Fereshteh Moradi, Cassandra Cunningham, Bishoy Seliman, Cydney R. Worsfold, Sarah Dolan, John Abando, Lucas A. Maddalena

Notice bibliographique

RevueOxidative Medicine and Cellular Longevity · 2018
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNitric Oxide and Endothelin Effects
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAffect (linguistics)OxygenCellOxygen metabolismCell biologyChemistryBiologyBiochemistryPsychologyCommunication

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most mammalian tissue cells experience oxygen partial pressuresin vivoequivalent to 1–6% O2(i.e., physioxia). In standard cell culture, however, headspace O2levels are usually not actively regulated and under these conditions are ~18%. This drives hyperoxia in cell culture media that can affect a wide variety of cellular activities and may compromise the ability ofin vitromodels to reproducein vivobiology. Here, we review and discuss some specific O2‐consuming organelles and enzymes, including mitochondria, NADPH oxidases, the transplasma membrane redox system, nitric oxide synthases, xanthine oxidase, and monoamine oxidase with respect to their sensitivities to O2levels. Many of these produce reactive oxygen and/or nitrogen species (ROS/RNS) as either primary end products or byproducts and are acutely sensitive to O2levels in the range from 1% to 18%. Interestingly, many of them are also transcriptional targets of hypoxia‐inducible factors (HIFs) and chronic cell growth at physioxia versus 18% O2may alter their expression. Aquaporins, which facilitate hydrogen peroxide diffusion into and out of cells, are also regulated by HIFs, indicating that O2levels may affect intercellular communication via hydrogen peroxide. The O2sensitivities of these important activities emphasize the importance of maintaining physioxia in culture.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations91
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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