Hierarchies of evolutionary radiation in the world’s most species rich vertebrate group, the Neotropical<i>Pristimantis</i>leaf litter frogs
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Notice bibliographique
Résumé
The Neotropical leaf litter frog genus Pristimantis is very species-rich, with 526 species described to date, but the full extent of its diversity is much higher and remains unknown. This study explores the phylogenetic processes and resulting evolutionary patterns of diversification in Pristimantis. Given the well-recognised failure of morphology- and community-based species groups to describe diversity within the genus, we apply a new test for the presence and phylogenetic distribution of higher evolutionary units. We developed a phylogeny based on 260 individuals encompassing 149 Pristimantis presumed species, sampled at mitochondrial and nuclear genes (3718 base pair alignment), combining new and available sequence data. Our phylogeny broadly agrees with previous studies, both in topology and age estimates, with the origin of Pristimantis at 28.97 (95% HDP =21.59 – 37.33) million years ago (MYA). New taxa that we add to the genus, which had not previously been included in Pristimantis phylogenies, suggest considerable diversity remains to be described. We assessed patterns of lineage origin and recovered 14 most likely (95% CI: 13–19) phylogenetic clusters or higher evolutionary significant units (hESUs) within Pristimantis. Diversification rates decrease towards the present following a density-dependent pattern for Pristimantis overall and for most hESU clusters, reflecting historical evolutionary radiation. The timing of diversification suggests that geological events in the Miocene, such as Andes orogenesis and Pebas system formation and drainage, may have had a direct or indirect impact on the evolution of Pristimantis and thus contributed to the origins of evolutionary independent phylogenetic clusters.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle