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Enregistrement W2894410744 · doi:10.1002/acn3.637

Altered tryptophan metabolism is associated with pediatric multiple sclerosis risk and course

2018· article· en· W2894410744 sur OpenAlexaff
Bardia Nourbakhsh, Pavan Bhargava, Helen Tremlett, Janace Hart, Jennifer Graves, Emmanuelle Waubant

Notice bibliographique

RevueAnnals of Clinical and Translational Neurology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueTryptophan and brain disorders
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeRace to Erase MSNational Multiple Sclerosis Society
Mots-clésMedicineKynurenineMetaboliteInternal medicineOdds ratioHazard ratioProportional hazards modelGut floraPhysiologyMicrobiomeTryptophanMetabolomicsConfidence intervalBioinformaticsImmunologyBiologyGeneticsAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To determine if altered tryptophan (Trp) metabolism is associated with MS risk or disease severity in children. METHODS: Participants with pediatric-onset MS and clinically isolated syndrome (CIS) within 4 years of disease onset and healthy controls underwent collection of serum. Longitudinal disability and processing speed measures and relapse data were collected in cases. Global metabolomics were conducted in 69/67 cases/controls. Targeted Trp measurement was performed in a discovery group (82 cases, 50 controls) and a validation group (92 cases, 50 controls), while functional gut microbiome analysis was done in 17 cases. Adjusted logistic, linear and negative binomial regression and Cox-proportional hazard models were used. RESULTS: Using global metabolomics data, higher relative abundances of Trp and indole lactate, a known gut microbiota-derived Trp metabolite, were associated with lower risk of MS. In cases, higher relative abundances of gut microbiota-derived Trp metabolites were associated with lower disability and higher processing speed scores and higher relative abundance of kynurenine was associated with higher relapse rate. Using targeted tryptophan measures, in the discovery and validation groups, each 1 mcg/mL increase in serum Trp level was associated with 20% (95% CI: 4-34%) and 32% (95% CI: 16-44%) decrease in adjusted odds of having MS, respectively. A lower relative abundance of gut microbial genes involved in Trp catabolism was associated with higher relapse risk. INTERPRETATION: Trp metabolism by the gut microbiota and the kynurenine pathway may be relevant to the risk of MS in children as well as MS activity and severity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,466

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,149
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations92
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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