2001. Susceptibility of <i>Aerococcus urinae</i> to Fluoroquinolones: Broth Microdilution and Gradient Diffusion
Notice bibliographique
Résumé
Aerococcus urinae is an emerging urinary pathogen frequently identified by MALDI-TOF. It is generally susceptible to β-lactams, however, its susceptibility pattern to fluoroquinolones (FQ) remains variable. The goals of this study were (i) to evaluate the performance of the gradient diffusion method (Etest®) to determine FQ resistance compared with broth microdilution (BMD) and (ii) to estimate the resistance rate of A. urinae toward FQ in Quebec hospitals. Two hundred seven consecutive isolates of A. urinae from urinary tract specimens originating from five hospitals in Quebec and Montreal were identified by MALDI-TOF (Vitek-MS and Bruker). All isolates were tested with the BMD and gradient diffusion methods. BMD was carried out in triplicate and was conducted in accordance with CLSI guidelines (M45-A3). Isolates with insufficient growth at 24 hours were reincubated and evaluated at 48 hours. The gradient diffusion method was carried out using Etest® strips on MH agar with 5% sheep blood. Of the 207 isolates of A. urinae, 52 (25%) gave uninterpretable results using the BMD method (insufficient growth = 20; trailing = 32). We obtained the following results for the remaining 155 isolates: BMD readings were often complicated by noticeably poor growth. The categorical agreement of the Etest® was 83% for ciprofloxacin and 95% for levofloxacin. Four very major errors were identified in a preliminary manner on 11% (4/35) of the ciprofloxacin-resistant isolates and 11%(4/35) of the levofloxacin-resistant isolates. Agar dilution will be done to confirm these results. In our experience, the method recommended by the CLSI for A. urinae susceptibility testing of FQ presented several problems, including insufficient growth and difficult reading. The Etest® appears to be a promising method for susceptibility testing of FQ for urinary tract isolates, but will first require a further comparison with agar dilution methods. In our study, the rate of FQ non-susceptibility of A. urinae was 27% for levofloxacin and 33% for ciprofloxacin. Therefore, FQ cannot be empirically recommended for the treatment of urinary tract infections caused by A. urinae. J. M. Leduc, Biomérieux: Investigator, Research grant.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».