Proteomic profile of root canal contents in teeth with post‐treatment endodontic disease
Notice bibliographique
Résumé
AIM: To characterize the proteome of 20 root canals in teeth with post-treatment endodontic disease using mass spectrometry and to correlate the identified proteins with clinical features. METHODOLOGY: Twenty patients with radiographic evidence of apical periodontitis and need for root canal re-treatment were selected. Samples from the root canal contents were collected and processed using two-dimensional capillary nano-flow liquid chromatography and electrospray ionization tandem mass spectrometry. The acquired spectra were separately searched against specific protein database. The results obtained were analysed using descriptive statistics. Additionally, Pearson's chi-square test or one-sided Fisher's exact test, as appropriate, was chosen to examine the null hypothesis that there is no relationship between each clinical feature and the presence of specific microbial or human proteins. Significance levels were set at 5% (P < 0.05). RESULTS: A total of 1153 human and 720 microbial UniProt accession numbers corresponding to proteins were recovered. The greater prevalence of proteins was related to biological functions, such as cellular and metabolic processes. A considerable number of microbial proteins with clinical relevance functions, such as pathogenesis/virulence, proteolysis, cell adhesion and drug resistance, were detected. Common endodontic pathogens related to post-treatment endodontic disease such as Enterococcus spp., Propionibacterium spp. and Streptococcus spp. were associated with 23, 40 and 94 distinct proteins, respectively. As for human proteins, many factors related to the immune system process were detected. No significant correlations were found between microbial and human proteins and the clinical features investigated (P > 0.05). CONCLUSIONS: A considerable number of microbial and human proteins were identified using proteomic analyses, being mainly related to processes indicating cell viability. No significant correlation was found between proteins and clinical features. These findings suggest a network of important microbial pathogenic functions that may be responsible for the host immune system response.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».