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Enregistrement W2894642038 · doi:10.1038/s41380-018-0118-1

Dose response of the 16p11.2 distal copy number variant on intracranial volume and basal ganglia

2018· article· en· W2894642038 sur OpenAlexafffund
Ida E. Sønderby, Ómar Gústafsson, Nhat Trung Doan, Derrek P. Hibar, Sandra Martin‐Brevet, Abdel Abdellaoui, David Ames, Katrin Amunts, Michael Andersson, Nicola J. Armstrong, Manon Bernard, Nicholas B. Blackburn, John Blangero, Dorret I. Boomsma, Janita Bralten, Hans-Richard Brattbak, Henry Brodaty, Rachel M. Brouwer, Robin Bülow, Vince D. Calhoun, Svenja Caspers, Gianpiero L. Cavalleri, Chi‐Hua Chen, Sven Cichon, Simone Ciufolini, Aiden Corvin, Benedicto Crespo‐Facorro, Joanne E. Curran, Anders M. Dale, Shareefa Dalvie, Paola Dazzan, Eco J. C. de Geus, Greig I. de Zubicaray, Sonja M. C. de Zwarte, Norman Delanty, Anouk den Braber, Sylvane Desrivières, Gary Donohoe, Bogdan Draganski, Stefan Ehrlich, Thomas Espeseth, Simon E. Fisher, Barbara Franke, Vincent Frouin, Masaki Fukunaga, Thomas Gareau, David C. Glahn, Hans J. Grabe, Nynke A. Groenewold, Jan Haavik, Asta K. Håberg, Ryota Hashimoto, Jayne Y. Hehir‐Kwa, Andreas Heinz, Manon H. J. Hillegers, Per Hoffmann, Laurena Holleran, Jouke‐Jan Hottenga, Hilleke E Hulshoff, Masashi Ikeda, Neda Jahanshad, Terry L. Jernigan, Christiane Jockwitz, Stefan Johansson, Guðrún A. Jónsdóttir, Erik G. Jönsson, René S. Kahn, Tobias Kaufmann, Sinéad Kelly, Masataka Kikuchi, Emma E. M. Knowles, Knut K. Kolskår, John B. Kwok, Stéphanie Le Hellard, Costin Leu, Jingyu Liu, Astri J. Lundervold, Arvid Lundervold, Nicholas G. Martin, Karen A. Mather, Samuel R. Mathias, Mark McCormack, Katie L. McMahon, Allan F. McRae, Yuri Milaneschi, Clara Moreau, Derek W. Morris, David Mothersill, Thomas W. Mühleisen, Robin Murray, Jan Egil Nordvik, Lars Nyberg, Loes M. Olde Loohuis, Roel A. Ophoff, Tomáš Paus, Zdenka Pausová, Brenda W.J.H. Penninx, Juan M. Peralta, Carlos Alberto Vanegas Prieto, Sara Pudas, Erin Burke Quinlan, Daniel Quintana, Céline S. Reinbold, Tiago Reis Marques, Alexandre Reymond, Geneviève Richard, Borja Rodríguez‐Herreros, Roberto Roiz‐Santiáñez, Jarek Rokicki, James Rucker, Perminder S. Sachdev, Anne‐Marthe Sanders, Sigrid Botne Sando, Lianne Schmaal, Peter R. Schofield, Andrew J. Schork, Günter Schumann, Jean Shin, Elena Shumskaya, Sanjay M. Sisodiya, Vidar M. Steen, Dan J. Stein, Stacy Steinberg, Lachlan T. Strike, Alexander Teumer, Anbupalam Thalamuthu, Diana Tordesillas‐Gutiérrez, Jessica A. Turner, Torill Ueland, Anne Uhlmann, Magnús Ö. Úlfarsson, Dennis van ‘t Ent, Dennis van der Meer, Neeltje E. M. van Haren, Anja Vaskinn, Evangelos Vassos, G. Bragi Walters, Yunpeng Wang, Wei Wen, Christopher D. Whelan, Katharina Wittfeld, Hidenaga Yamamori, Tetyana Zayats, Ingrid Agartz, Lars T. Westlye, Sébastien Jacquemont, Srdjan Djurovic, Hreinn Stefánsson, Kāri Stefánsson, Paul M. Thompson, Ole A. Andreassen

Notice bibliographique

RevueMolecular Psychiatry · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversity of TorontoSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthNorwegian Institute of Public HealthInstitute for Molecular Bioscience, University Of QueenslandBiodiversity Institute, University of FloridaNational Institutes of HealthNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringAmsterdam NeuroscienceHeinz Nixdorf StiftungMission Interministérielle de Lutte Contre les Drogues et les Conduites AddictivesUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustCentre Hospitalier Universitaire VaudoisMax Planck Instituut voor PsycholinguïstiekUniversidad de CantabriaRadboud Universitair Medisch CentrumUniversité Paris-SaclayHospital for Sick ChildrenUniversity of California, San DiegoUniversitetet i OsloUniversité de MontréalRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnUniversitair Medisch Centrum GroningenUniversitetet i BergenUmeå UniversitetGGZ inGeestDeutsche ForschungsgemeinschaftMurdoch UniversityNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekErasmus Medisch CentrumNational Institute for Physiological SciencesVrije Universiteit AmsterdamInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleDepartment of Psychiatry, University of TorontoAgence Nationale de la RechercheFondation de FranceTrinity College DublinMedical Research CouncilEpilepsy SocietyUniversity of GalwayNational Institute for Health and Care ResearchSouth London and Maudsley NHS Foundation TrustFondation pour la Recherche MédicaleBergens ForskningsstiftelseSvenska Forskningsrådet FormasHorizon 2020 Framework ProgrammeFujita Health UniversityVetenskapsrådetUniversiteit UtrechtUniversität BaselNorges ForskningsrådQIMR Berghofer Medical Research InstituteUniversity of Southern CaliforniaUniversité de LausanneUniversity College LondonInstitute of Psychiatry, Psychology and Neuroscience, King’s College LondonCentre de recherche du CHU Sainte-JustineBundesministerium für Bildung und ForschungRoyal College of Surgeons in IrelandNasjonalforeningen for FolkehelsenSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungUniversiteit LeidenUniversity of New South WalesNational University of IrelandNational Science FoundationAmgenScience Foundation IrelandU.S. Department of EnergyYale UniversityKarolinska InstitutetJanssen Research and DevelopmentZonMwNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesLeids Universitair Medisch CentrumNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionNorges Teknisk-Naturvitenskapelige UniversitetUniversity of California, Los AngelesInstituto de Investigación Marqués de ValdecillaEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchUniversity of Texas Rio Grande ValleyEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentHaukeland UniversitetssjukehusSimons Foundation Autism Research InitiativeHelse Midt-NorgeHersenstichtingRWTH Aachen UniversityCentro de Investigación Biomédica en Red de Salud MentalRadboud UniversiteitChild Mind InstituteSimons FoundationUniversity of TorontoImperial College LondonKing's College LondonEuropean Commission
Mots-clésBasal gangliaNeuroscienceBasal (medicine)PsychologyBiologyMedicineInternal medicineCentral nervous system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Carriers of large recurrent copy number variants (CNVs) have a higher risk of developing neurodevelopmental disorders. The 16p11.2 distal CNV predisposes carriers to e.g., autism spectrum disorder and schizophrenia. We compared subcortical brain volumes of 12 16p11.2 distal deletion and 12 duplication carriers to 6882 non-carriers from the large-scale brain Magnetic Resonance Imaging collaboration, ENIGMA-CNV. After stringent CNV calling procedures, and standardized FreeSurfer image analysis, we found negative dose-response associations with copy number on intracranial volume and on regional caudate, pallidum and putamen volumes ( β = −0.71 to −1.37; P < 0.0005). In an independent sample, consistent results were obtained, with significant effects in the pallidum ( β = −0.95, P = 0.0042). The two data sets combined showed significant negative dose-response for the accumbens, caudate, pallidum, putamen and ICV ( P = 0.0032, 8.9 × 10 −6 , 1.7 × 10 − 9 , 3.5 × 10 −12 and 1.0 × 10 −4 , respectively). Full scale IQ was lower in both deletion and duplication carriers compared to non-carriers. This is the first brain MRI study of the impact of the 16p11.2 distal CNV, and we demonstrate a specific effect on subcortical brain structures, suggesting a neuropathological pattern underlying the neurodevelopmental syndromes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,386
Score d'incertitude au seuil0,480

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations74
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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