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Enregistrement W2895211752 · doi:10.1042/bcj20180523

Variants with increased negative electrostatic potential in the Cx50 gap junction pore increased unitary channel conductance and magnesium modulation

2018· article· en· W2895211752 sur OpenAlexaff
Mary Grace Tejada, Swathy Sudhakar, Nicholas K. Kim, Hiroshi Aoyama, Brian H. Shilton, Donglin Bai

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGatingGap junctionConductanceBiophysicsExtracellularChemistryMagnesiumIntracellularStatic electricityBiochemistryBiologyPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gap junction (GJ) channels are oligomers of connexins forming channels linking neighboring cells. GJs formed by different connexins show distinct unitary channel conductance (γj), transjunctional voltage-dependent gating (Vj-gating) properties, and modulation by intracellular magnesium ([Mg2+]i). The underlying molecular determinants are not fully clear. Previous experimental evidence indicates that residues in the amino terminal (NT) and initial segment of the first extracellular (E1) domain influence the γj, Vj-gating, and/or [Mg2+]i modulation in several GJs. Increasing negatively charged residues in Cx50 (connexin50) E1 (G46D or G46E) increased γj, while increasing positively charged residue (G46K) reduced the γj. Sequence alignment of Cx50 and Cx37 in the NT and E1 domains revealed that in Cx50 G8 and V53, positions are negatively charged residues in Cx37 (E8 and E53, respectively). To evaluate these residues together, we generated a triple variant in Cx50, G8E, G46E, and V53E simultaneously to study its γj, Vj-gating properties, and modulation by [Mg2+]i. Our data indicate that the triple variant and individual variants G8E, G46E, and V53E significantly increased Cx50 GJ γj without a significant change in the Vj gating. In addition, elevated [Mg2+]i reduced γj in Cx50 and all the variant GJs. These results and our homology structural models suggest that these NT/E1 residues are likely to be pore-lining and the variants increased the negative electrostatic potentials along the GJ pore to facilitate the γj of this cation-preferring GJ channel. Our results indicate that electrostatic properties of the Cx50 GJ pore are important for the γj and the [Mg2+]i modulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,413
Score d'incertitude au seuil0,422

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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