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Enregistrement W2895236495 · doi:10.7717/peerj.5703

The potential contribution of miRNA-200-3p to the fatty acid metabolism by regulating<i>AjEHHADH</i>during aestivation in sea cucumber

2018· article· en· W2895236495 sur OpenAlexaff
Muyan Chen, Shanshan Wang, Xingke Li, Kenneth B. Storey, Xiumei Zhang

Notice bibliographique

RevuePeerJ · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEchinoderm biology and ecology
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésAestivationSea cucumberApostichopus japonicusBiologyPeroxisomeFatty acid metabolismBiochemistryFatty acidmicroRNAMessenger RNACell biologyGeneEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The sea cucumber ( Apostichopus japonicus ) has become a good model organism for studying environmentally-induced aestivation by a marine invertebrate more recently. In the present study, we hypothesized that miRNA-200-3p may contribute to establish rapid biological control to regulate fatty acid metabolism during a estivation. The peroxisomal bi-functional enzyme (EHHADH) is a crucial participant of the classical peroxisomal fatty acid β -oxidation pathway, the relative mRNA transcripts and protein expressions of EHHADH were analyzed in intestine from sea cucumbers experienced long-term aestivation. Both mRNA transcripts and protein expressions of EHHADH in intestine decreased significantly during deep-aestivation as compared with non-aestivation controls. Analysis of the 3′ UTR of AjEHHADH showed the presence of a conserved binding site for miR-200-3p. Level of miR-200-3p showed an inverse correlation with EHHADH mRNA transcripts and protein levels in intestine, implicating miR-200-3p may directly targeted AjEHHADH by inducing the degradation of AjEHHADH mRNA in the aestivating sea cucumber, further dual-luciferase reporter assay validated the predicted role of miRNA-200-3p in regulating AjEHHADH . In order to further understand their regulatory mechanism, we conducted the functional experiment in vivo. The overexpression of miR-200-3p in sea cucumber significantly decreased mRNA and protein expression levels of AjEHHADH . Taken together, these findings suggested the potential contribution of miRNA-200-3p to the fatty acid metabolism by regulating AjEHHADH during aestivation in sea cucumber.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,756
Score d'incertitude au seuil0,673

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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