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Enregistrement W2895282634 · doi:10.1177/1469066718802547

Hydrogen atom transfer in the radical cations of tryptophan-containing peptides AW and WA studied by mass spectrometry, infrared multiple-photon dissociation spectroscopy, and theoretical calculations

2018· article· en· W2895282634 sur OpenAlexaff
Andrii Piatkivskyi, Justin Kai‐Chi Lau, Giel Berden, Jos Oomens, Alan C. Hopkinson, KW Michael Siu, Victor Ryzhov

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Mass Spectrometry · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of WindsorYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryTryptophanRadical ionDissociation (chemistry)RadicalPhotochemistryProtonationHydrogen atom abstractionHydroxyl radicalMedicinal chemistryIonOrganic chemistryAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two types of radical cations of tryptophan—the π-radical cation and the protonated tryptophan-N radical—have been studied in dipeptides AW and WA. The π-radical cation produced by removal of an electron during collision-induced dissociation of a ternary Cu(II) complex was only observed for the AW peptide. In the case of WA, only the ion corresponding to the loss of ammonia, [WA–NH 3 ] •+ , was observed from the copper complex. Both protonated tryptophan-N radicals were produced by N-nitrosylation of the neutral peptides followed by transfer to the gas phase via electrospray ionization and subsequent collision-induced dissociation. The regiospecifically formed N • species were characterized by infrared multiple-photon dissociation spectroscopy which revealed that the WA tryptophan-N • radical remains the nitrogen radical, while the AW nitrogen radical rearranges into the π-radical cation. These findings are supported by the density functional theory calculations that suggest a relatively high barrier for the radical rearrangement (N • to π) in WA (156.3 kJ mol −1 ) and a very low barrier in AW (6.1 kJ mol −1 ). The facile hydrogen atom migration in the AW system is also supported by the collision-induced dissociation of the tryptophan-N radical species that produces fragments characteristic of the tryptophan π-radical cation. Gas-phase ion–molecule reactions with n-propyl thiol have also been used to differentiate between the π-radical cations (react by hydrogen abstraction) and the tryptophan-N • species (unreactive) of AW.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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