Horsepox and the need for a new norm, more transparency, and stronger oversight for experiments that pose pandemic risks
Notice bibliographique
Résumé
In January, Dr. David Evans from the University of Alberta and his colleagues published a scientific paper describing the synthesis of the horsepox virus de novo [1].Horsepox doesn't cause infection in humans, but another related virus-Variola major-causes smallpox.The publication of the horsepox synthesis process lowers technical hurdles for making smallpox de novo.This commentary argues that there are serious potential adverse implications of this work that don't justify the purported benefits.It also makes the case that there should be a new norm related to experiments that increase pandemic risks and that there should be more transparency and stronger oversight for biological research and science that increases pandemic risks. Implications of synthesisHorsepox is in the same viral family as smallpox; both are orthopox viruses.There has been no prior published report of an orthopox synthesis, so this experiment is the first time researchers have published a description of how to make a virus closely related to smallpox.In doing and publishing the horsepox synthesis work, the researchers have reduced uncertainties and addressed potential barriers that scientists would encounter in an effort to synthesize smallpox.In the paper, the scientists describe how they addressed "challenges" in the work [1].For a scientific group determined to synthesize smallpox de novo, the paper would be useful.Drew Endy, a synthetic biologist on WHO's Advisory Committee on Variola Virus Research (ACVVR), said about the publication, "There are things in this paper that I wouldn't know how to do and had never been done before" [2].Other virologists have commented that they did not think the paper was a major technical advance; even if this were the case, it seems quite ill-advised to publish the full prescriptive details of the synthesis in one manuscript.Even Evans and colleagues said in the conclusion of their paper, ". . .This is clearly an example of dual-use research, and observations like these pose significant challenges for public health authorities" [1].Why be concerned about making it easier to synthesize smallpox de novo?There are two primary reasons.First, there are intentional, extraordinary barriers in place to obtaining live samples of smallpox.There are only two official repositories of smallpox in the world (the United States Centers for Disease Control and Prevention [CDC] in Atlanta, Georgia, and the State Research Centre of Virology and Biotechnology [VECTOR] in Novosibirsk, Russia) [3], and to do research with smallpox in one of these facilities requires the permission of the
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,147 | 0,155 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,007 | 0,057 |
| Communication savante | 0,018 | 0,021 |
| Science ouverte | 0,007 | 0,007 |
| Intégrité de la recherche | 0,040 | 0,043 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».