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Enregistrement W2895484534 · doi:10.1371/journal.ppat.1007129

Horsepox and the need for a new norm, more transparency, and stronger oversight for experiments that pose pandemic risks

2018· article· en· W2895484534 sur OpenAlexaboutno aff
Tom Inglesby

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesOpen Philanthropy Project
Mots-clésTransparency (behavior)PandemicNorm (philosophy)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)Computer scienceComputer securityPolitical scienceMedicineLawInfectious disease (medical specialty)Disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In January, Dr. David Evans from the University of Alberta and his colleagues published a scientific paper describing the synthesis of the horsepox virus de novo [1].Horsepox doesn't cause infection in humans, but another related virus-Variola major-causes smallpox.The publication of the horsepox synthesis process lowers technical hurdles for making smallpox de novo.This commentary argues that there are serious potential adverse implications of this work that don't justify the purported benefits.It also makes the case that there should be a new norm related to experiments that increase pandemic risks and that there should be more transparency and stronger oversight for biological research and science that increases pandemic risks. Implications of synthesisHorsepox is in the same viral family as smallpox; both are orthopox viruses.There has been no prior published report of an orthopox synthesis, so this experiment is the first time researchers have published a description of how to make a virus closely related to smallpox.In doing and publishing the horsepox synthesis work, the researchers have reduced uncertainties and addressed potential barriers that scientists would encounter in an effort to synthesize smallpox.In the paper, the scientists describe how they addressed "challenges" in the work [1].For a scientific group determined to synthesize smallpox de novo, the paper would be useful.Drew Endy, a synthetic biologist on WHO's Advisory Committee on Variola Virus Research (ACVVR), said about the publication, "There are things in this paper that I wouldn't know how to do and had never been done before" [2].Other virologists have commented that they did not think the paper was a major technical advance; even if this were the case, it seems quite ill-advised to publish the full prescriptive details of the synthesis in one manuscript.Even Evans and colleagues said in the conclusion of their paper, ". . .This is clearly an example of dual-use research, and observations like these pose significant challenges for public health authorities" [1].Why be concerned about making it easier to synthesize smallpox de novo?There are two primary reasons.First, there are intentional, extraordinary barriers in place to obtaining live samples of smallpox.There are only two official repositories of smallpox in the world (the United States Centers for Disease Control and Prevention [CDC] in Atlanta, Georgia, and the State Research Centre of Virology and Biotechnology [VECTOR] in Novosibirsk, Russia) [3], and to do research with smallpox in one of these facilities requires the permission of the

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,147
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,155
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Évaluation · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,960
Score d'incertitude au seuil0,777

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1470,155
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0070,057
Communication savante0,0180,021
Science ouverte0,0070,007
Intégrité de la recherche0,0400,043
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,094
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineÉvaluation
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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