Microbiology of the sulfur-dominated glacial ecosystem at Borup Fiord Pass, and high arctic low-temperature spring associated microbial mats, The
Notice bibliographique
Résumé
Borup Fiord Pass (BFP) located on Ellesmere Island in the Canadian High Arctic is a unique low-temperature environment.BFP is a sulfur-dominated ecosystem that occurs within the Krieger mountains.Here, a subglacial spring emergences from the toe of a coalescence glacier.The presence of high concentrations of sulfur and low temperatures make BFP an excellent terrestrial analog for the study of potential astrobiological targets.High concentrations of sulfur also make BFP an ideal location for studying how microbial organisms can utilize reduced and oxidized forms of sulfur to thrive in cold environments.Yet, due to human influence Arctic research sites may not remain cold perpetually also making the location ideal to study climate change.Over field campaigns in 2014, 2016, and 2017, numerous samples were collected and analyzed for microbial community composition (16S rRNA gene sequencing), function (metagenomic sequencing), and aqueous geochemistry.16S rRNA gene sequencing data revealed Flavobacterium was common to almost all samples.Sulfur-oxidizing microorganisms (Sulfurimonas, Sulfurovum, and Sulfuricurvum), and an organism that specializes in the disproportionation of inorganic sulfur compounds (Desulfocapsa) were also abundant in samples with high concentrations of sulfur compounds.To link the identified microbial taxa to function, assembly and binning of metagenomic sequence data was carried out and produced 31 reportable metagenome assembled genomes (MAGs), which revealed that sulfur oxidation may be a cosmopolitan process at BFP.Overall, results suggest that while sulfur cycling organisms dominate during acute events, a basal community structure appears to dominate over time and site type and that functional redundancy may be a key mechanism utilized by microorganisms for energy generation in this low-temperature environment.Finally, to address the changing Arctic climate the community composition and function of microbial iv mats found across Ellesmere Island was characterized.To my knowledge these are the most northern microbial mats ever identified, potentially acting as a barometer to study climate change and its effect on polar environments.Microbial community composition varied significantly between sample sites.Metagenomes were sequenced from one site, Ice River, revealing the potential for sulfur oxidation, nitrate/nitrite reduction, and carbon fixation via the reductive acetyl-CoA and reverse TCA cycles.Also found were genes that allow microorganisms to adapt to adverse conditions in extreme environments.High Arctic microbial communities help to guide our search for potential life on extraterrestrial worlds, and further enhance our knowledge of low-temperature ecosystems on Earth as our climate continues to change.v
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».