Genetic Characterization of Maximilian Sunflower for the Development of a Locally Adapted Perennial Grain Oilseed
Notice bibliographique
Résumé
Maximilian sunflower ( Helianthus maximiliani Schrad.), a crop wild relative of sunflower ( Helianthus annuus L.), has been identified as a species of interest for the development of a perennial oilseed crop. Knowledge of the diversity, the potential for crop development, and genomic resources of this crop wild relative is limited. To facilitate its use in breeding programs, a baseline characterization of locally adapted germplasm is required to develop informed breeding strategies. Individuals were collected from nine sites in southern Manitoba, Canada, and characterized for phenotypic and genotypic divergence to estimate traits of interest for the implementation of a breeding program in Maximilian sunflower. Genotype‐by‐sequencing was used to characterize population genetic parameters and identify candidate single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with phenotypic divergence and environmental differences between collection sites. Candidate SNPs associated with frost‐free period, temperature during the primary vegetative growth period, elevation, soil CaCO 3 equivalent, days to anthesis and capitulum size were identified and may be useful for the improvement of H. maximiliani and crop species related to cultivated sunflower. Associations between temperature, population structure, and overall plant size were also identified, suggesting phenotypic divergence across a local temperature gradient. The sampled Maximilian sunflower populations exhibited a high degree of polymorphism, low levels of inbreeding, and a highly heterozygous genome at the local scale, traits that favor the establishment of locally adapted germplasm pools. There appears to be sufficient variation to make selections for agronomic traits in local germplasm of Maximilian sunflower to support its development as a perennial oilseed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».