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Enregistrement W2895871623 · doi:10.1016/j.copbio.2018.10.001

Lignin polymerization: how do plants manage the chemistry so well?

2018· review· en· W2895871623 sur OpenAlexaff
Yuki Tobimatsu, Mathias Schuetz

Notice bibliographique

RevueCurrent Opinion in Biotechnology · 2018
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMonolignolLigninPolymerizationLaccaseChemistryCell wallPeroxidasePolymerApoplastSecondary cell wallBiochemistryOrganic chemistryBiosynthesisEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The final step of lignin biosynthesis is the polymerization of monolignols in apoplastic cell wall domains. In this process, monolignols secreted by lignifying cells, or occasionally neighboring non-lignifying and/or other lignifying cells, are activated by cell-wall-localized oxidation systems, such as laccase/O 2 and/or peroxidase/H 2 O 2 , for combinatorial radical coupling to make the final lignin polymers. Plants can precisely control when, where, and which types of lignin polymers are assembled at tissue and cellular levels, but do not control the polymers’ exact chemical structures per se . Recent studies have begun to identify specific laccase and peroxidase proteins responsible for lignin polymerization in specific cell types and during different developmental stages. The coordination of polymerization machinery localization and monolignol supply is likely critical for the spatio-temporal patterning of lignin polymerization. Further advancement in this research area will continue to increase our capacity to manipulate lignin content/structure in biomass to meet our own biotechnological purposes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations319
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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