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Enregistrement W2895993819 · doi:10.3390/healthcare6040125

Under-Detection of Lyme Disease in Canada

2018· article· en· W2895993819 sur OpenAlexafffundabout
Vett K. Lloyd, Ralph G. Hawkins

Notice bibliographique

RevueHealthcare · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensSouth Health CampusUniversity of CalgaryMount Allison University
Organismes subventionnairesFondation canadienne de la maladie de LymeNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésLyme diseaseSerologyIncidence (geometry)DiseaseLYMEBorrelia burgdorferiMedicineTickBorreliaImmunologyVirologyAntibodyPathologyMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lyme disease arises from infection with pathogenic Borrelia species. In Canada, current case definition for confirmed Lyme disease requires serological confirmation by both a positive first tier ELISA and confirmatory second tier immunoblot (western blot). For surveillance and research initiatives, this requirement is intentionally conservative to exclude false positive results. Consequently, this approach is prone to false negative results that lead to underestimation of the number of people with Lyme disease. The province of New Brunswick (NB), Canada, can be used to quantify under-detection of the disease as three independent data sets are available to generate an estimate of the true human disease prevalence and incidence. First, detailed human disease incidence is available for the US states and counties bordering Canada, which can be compared with Canadian disease incidence. Second, published national serology results and well-described sensitivity and specificity values for these tests are available and deductive reasoning can be used to query for discrepancies. Third, high-density tick and canine surveillance data are available for the province, which can be used to predict expected human Lyme prevalence. Comparison of cross-border disease incidence suggests a minimum of 10.2 to 28-fold under-detection of Lyme disease (3.6% to 9.8% cases detected). Analysis of serological testing predicts the surveillance criteria generate 10.4-fold under-diagnosis (9.6% cases detected) in New Brunswick for 2014 due to serology alone. Calculation of expected human Lyme disease cases based on tick and canine infections in New Brunswick indicates a minimum of 12.1 to 58.2-fold underestimation (1.7% to 8.3% cases detected). All of these considerations apply generally across the country and strongly suggest that public health information is significantly under-detecting and under-reporting human Lyme cases across Canada. Causes of the discrepancies between reported cases and predicted actual cases may include undetected genetic diversity of Borrelia in Canada leading to failed serological detection of infection, failure to consider and initiate serological testing of patients, and failure to report clinically diagnosed acute cases. As these surveillance criteria are used to inform clinical and public health decisions, this under-detection will impact diagnosis and treatment of Canadian Lyme disease patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,437

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,005
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0020,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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