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Enregistrement W2896010663 · doi:10.1093/infdis/jiy607

<i>Plasmodium falciparum</i>-CD36 Structure-Function Relationships Defined by Ortholog Scanning Mutagenesis

2018· article· en· W2896010663 sur OpenAlexafffund
Ana Cabrera, Dante Neculai, Vanessa Tran, Thomas Lavstsen, Louise Turner, Kevin C. Kain

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensUniversity of TorontoToronto General HospitalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Science Foundation of Zhejiang ProvinceNational Natural Science Foundation of ChinaCanada Research Chairs
Mots-clésPlasmodium falciparumMutagenesisBiologyCD36Function (biology)GeneticsComputational biologyMutationVirologyGeneMalariaImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The interaction of Plasmodium falciparum-infected erythrocytes (IEs) with the host receptor CD36 is among the most studied host-parasite interfaces. CD36 is a scavenger receptor that binds numerous ligands including the cysteine-rich interdomain region (CIDR)α domains of the erythrocyte membrane protein 1 family (PfEMP1) expressed on the surface of IEs. CD36 is conserved across species, but orthologs display differential binding of IEs. METHODS: In this study, we exploited these differences, combined with the recent crystal structure and 3-dimensional modeling of CD36, to investigate malaria-CD36 structure-function relationships and further define IE-CD36 binding interactions. RESULTS: We show that a charged surface in the membrane-distal region of CD36 is necessary for IE binding. Moreover, IE interaction with this binding surface is influenced by additional CD36 domains, both proximal to and at a distance from this site. CONCLUSIONS: Our data indicate that subtle sequence and spatial differences in these domains modify receptor conformation and regulate the ability of CD36 to selectively interact with its diverse ligands.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,136
Score d'incertitude au seuil0,513

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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