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Enregistrement W2896138992 · doi:10.1097/yco.0000000000000465

Towards the integration of pharmacogenetics in psychiatry

2018· review· en· W2896138992 sur OpenAlexafffund
Chad Bousman, Abdullah Al Maruf, Daniel J. Müller

Notice bibliographique

RevueCurrent Opinion in Psychiatry · 2018
Typereview
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental HealthAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPharmacogeneticsPharmacogenomicsCYP2C19MedicineGenetic testingDosingPsychiatryPharmacologyPsychologyGeneticsGeneBiologyGenotypeInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE OF REVIEW: The implementation of pharmacogenetic testing in psychiatry is underway but is not yet standard protocol. Barriers to pharmacogenetics becoming standard practice are the lack of translation of evidence-based recommendations and standardization of genetic testing panels. As for the latter, there are currently no regulatory standards related to the gene and allele content of testing panels used to derive medication selection and dosing advice. To address these barriers, we summarize the current gene-drug interaction knowledgebase and proposed a minimum gene and allele set for pharmacogenetic testing in psychiatry. RECENT FINDINGS: The Pharmacogenomics Knowledgebase has cataloged 448 gene-drug interactions relevant to psychiatry based on the current scientific literature, drug labels, and pharmacogenetic-based implementation guidelines. A majority of these interactions involved two cytochrome P450 enzymes (CYP2D6 and CYP2C19) and antidepressant medications, however, CYP2C9, HLA-A, and HLA-B are relevant to mood stabilizers/anticonvulsants. SUMMARY: On the basis of evidence base, we proposed a minimum gene and allele set for pharmacogenetic testing in psychiatry that includes 16 variant alleles within five genes (CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, HLA-A, HLA-B). The intent is to assist clinicians in judging the gene and allele content of pharmacogenetic tests and to facilitate pharmacogenetic testing as a standard protocol and companion tool for psychotropic medication selection and dosing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,943
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,356
Tête enseignante GPT0,554
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations115
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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