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Enregistrement W2896247950 · doi:10.1002/jcp.27321

Characterizing the three‐dimensional organization of telomeres in papillary thyroid carcinoma cells

2018· article· en· W2896247950 sur OpenAlexafffund
Paola Caria, Tinuccia Dettori, Daniela Virginia Frau, Daniel Lichtenzstejn, Roberta Vanni, Sabine Mai

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Physiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensUniversity of ManitobaCancerCare Manitoba
Organismes subventionnairesFondazione Umberto VeronesiCanadian Institutes of Health ResearchMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della Ricerca
Mots-clésTelomereThyroid carcinomaBiologyFluorescence in situ hybridizationCancer researchThyroid cancerCancerIn situ hybridizationMolecular biologyThyroidEndocrinologyDNAGeneGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The relationship between the three‐dimensional (3D) nuclear telomere architecture and specific genetic alterations in papillary thyroid carcinoma (PTC), in particular in cancer stem‐like cells (CSLCs), has not yet been investigated. We isolated thyrospheres containing CSLCs from B‐CPAP, K1, and TPC‐1 PTC‐derived cell lines, representative of tumors with different genetic backgrounds within the newly identified BRAF V600E ‐like PTC subgroup, and used immortalized normal human thyrocytes (Nthy‐ori 3.1) as control. We performed quantitative fluorescence in situ hybridization, 3D imaging, and 3D telomere analysis using TeloView software to examine telomere dysfunction in both parental and thyrosphere cells. Among the 3D telomere profile, a wide heterogeneity was observed, except for telomere intensity. Our findings indicate that CSLCs of each cell line had longer telomeres than parental cells, according to telomere intensity values, which correlate with telomere length. Indeed, the thyrosphere cells had lower numbers of lower‐intensity telomeres (≤5,000 arbitrary fluorescent units, a.u.), compared with parental cancer cells, as well as parental control cells, ( p < 0.0001). The B‐CPAP thyrospheres showed a decreased number of higher intensity telomeres (>17,000 a.u.) than K1 and TPC‐1 cells, as well as control cells ( p < 0.0001). By selecting PTC‐derived cell lines with different genetic backgrounds characteristic of BRAF V600E ‐like PTC subgroups, we demonstrate that thyrosphere cells with BRAF V600E and TP53 mutations show shorter telomeres than those harboring RET/PTC or BRAF V600E and wild‐type TP53. Hence, our data reveal a trend towards a decrease in telomere shortening in CSLCs, representing the early cancer‐promoting subpopulation, as opposed to parental cells representing the tumor bulk cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,314
Score d'incertitude au seuil0,384

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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