Biallelic mutations in EXOC3L2 cause a novel syndrome that affects the brain, kidney and blood
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Dandy-Walker malformation features agenesis/hypoplasia of the cerebellar vermis, cystic dilatation of the fourth ventricle and enlargement of posterior fossa. Although Dandy-Walker malformation is relatively common and several genes were linked to the syndrome, the genetic cause in the majority of cases is unknown. OBJECTIVE: To identify the mutated gene responsible for Dandy-Walker malformation, kidney disease and bone marrow failure in four patients from two unrelated families. METHODS: Medical assessment, sonographic, MRI and pathological studies were used to define phenotype. Chromosomal microarray analysis and whole-exome sequence were performed to unravel the genotype. RESULTS: functions in trafficking of post-Golgi vesicles to the plasma membrane. In the first family a missense mutation in a highly conserved amino acid, p.Leu41Gln, was found in three fetuses; all had severe forms of Dandy-Walker malformation that was detectable by prenatal ultrasonography and confirmed by autopsy. In the second family, the affected child carried a nonsense mutation, p.Arg72*, and no detected protein. He had peritrigonal and cerebellar white matter abnormalities with enlargement of the ventricular trigones, developmental delay, pituitary hypoplasia, severe renal dysplasia and bone marrow failure. CONCLUSION: mutations lead to a novel syndrome that affects hindbrain development, kidney and possibly the bone marrow.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».