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Enregistrement W2896289324 · doi:10.1002/dta.2523

Zebrafish (<scp><i>Danio rerio</i></scp>) water tank model for the investigation of drug metabolism: Progress, outlook, and challenges

2018· article· en· W2896289324 sur OpenAlexfundno aff
Vinícius Figueiredo Sardela, Carina de Souza Anselmo, Isabelle Karine da Costa Nunes, Gabriel Reis Alves Carneiro, Gustavo Ramalho Cardoso dos Santos, Aline Reis de Carvalho, Bruna de Jesus Labanca, Daniely Silva Oliveira, William Ribeiro, Amanda Lessa Dutra de Araujo, Mônica Costa Padilha, Cleverton Kleiton Freitas de Lima, Valéria Pereira de Sousa, Francisco Radler de Aquino Neto, Henrique Marcelo Gualberto Pereira

Notice bibliographique

RevueDrug Testing and Analysis · 2018
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistério do EsporteFundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de JaneiroConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoWorld Anti-Doping Agency
Mots-clésDanioZebrafishDrugDrug metabolismChemistryComputational biologyPharmacologyBiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Zebrafish (Danio rerio) water tank (ZWT) approach was investigated as an alternative model for metabolism studies based on six different experiments with four model compounds. Sibutramine was applied for the multivariate optimization of ZWT conditions, also for the comparison of the metabolism among ZWT, humans and mice, beyond for the role of CYP2B6 in ZWT. After the optimization, 18 fish and 168 hours of experiments is the minimum requirement for a relevant panel of biotransformation products. A comparison among the species resulted in the observation of the same hydroxylated metabolites, with differences in metabolites concentration ratio. However, the ZWT allowed tuning of the conditions to obtain a specific metabolic profile, depending on the need. In addition, by utilizing CYP2B6 inhibition, a relevant ZWT pathway for the demethylation of drugs was determined. The stereospecificity of the ZWT metabolism was investigated using selegiline and no racemization or inversion transformations were observed. Moreover, the investigation of metabolism of cannabimimetics was performed using JWH-073 and the metabolites observed are the same described for humans, except for the hydroxylation at the indol group, which was explained by the absence of CYP2C9 orthologs in zebrafish. Finally, hexarelin was used as a model to evaluate studies by ZWT for drugs with low stability. As a result, hexarelin displays a very fast metabolization in ZWT conditions and all the metabolites described for human were observed in ZWT. Therefore, the appropriate conditions, merits, and relevant limitations to conduct ZWT experiments for the investigation of drug metabolism are described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,837
Score d'incertitude au seuil0,780

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,128
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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