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Enregistrement W2896362239 · doi:10.1128/mbio.02073-17

<i>SLC6A14</i> Is a Genetic Modifier of Cystic Fibrosis That Regulates <i>Pseudomonas aeruginosa</i> Attachment to Human Bronchial Epithelial Cells

2017· article· en· W2896362239 sur OpenAlexafffund
Michelle Di Paola, Amber J. Park, Saumel Ahmadi, Elyse J. Roach, Yu-Sheng Wu, Michaela C. Strüder‐Kypke, Joseph S. Lam, Christine E. Bear, Cezar M. Khursigara

Notice bibliographique

RevuemBio · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensUniversity of GuelphHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésCystic fibrosisPseudomonas aeruginosaArginineChemistryBiologyMicrobiologyAmino acidGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Cystic fibrosis (CF) is caused by mutations in the CFTR gene and is associated with progressive and ultimately fatal infectious lung disease. There can be considerable variability in disease severity among individuals with the same CFTR mutations, and recent genome-wide association studies have identified secondary genetic factors that contribute to this. One of these modifier genes is SLC6A14 , which encodes an amino acid transporter. Importantly, variants of this gene have been associated with age at first acquisition of Pseudomonas aeruginosa . In this study, we aimed to determine the function of SLC6A14 in airway epithelia and how it might affect colonization by P. aeruginosa . We show that SLC6A14 is expressed in respiratory epithelial cells and transports l -arginine out of the airway surface liquid (ASL). Exposure of airway epithelia to flagellin from P. aeruginosa led to upregulation of SLC6A14 expression and increased SLC6A14-dependent uptake of l -arginine from the ASL. In support of the hypothesis that l -arginine affects P. aeruginosa attachment, we showed that l -arginine supplementation promoted P. aeruginosa attachment to an abiotic surface in a dose-dependent manner. In a coculture model, we found that inhibition of SLC6A14-dependent l -arginine transport enhanced P. aeruginosa attachment. In Slc6a14 −/y (knockout) mice, P. aeruginosa attachment to lung tissue was also significantly enhanced. Together, these findings suggest that SLC6A14 activity plays a role in the modification of the initial stages of airway infection by altering the level of l -arginine in the ASL, which in turn affects the attachment of P. aeruginosa . IMPORTANCE CF patients with shared CFTR gene mutations show significant variability in their clinical presentation of infectious lung disease. Genome-wide association studies have been used to identify secondary genetic factors that may explain the variable susceptibility to infection by opportunistic pathogens, including P. aeruginosa , the leading cause of pathogen-induced lung damage in nonpediatric CF patients. Once identified and characterized, these secondary genetic modifiers may allow for the development of personalized medicine for patients and ultimately the extension of life. In this study, we interrogated the biological role of one of these modifiers, SLC6A14 , and showed that it contributes to host defense by depleting extracellular arginine (an attachment-promoting metabolite for P. aeruginosa ) from the airway surface liquid.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,096
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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