Single cell RNA sequencing of human liver reveals distinct intrahepatic macrophage populations

2018· article· en· 1 620 citations· W2896518632 sur OpenAlex· 10.1038/s41467-018-06318-7

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,044

Tête enseignante GPT0,296

Écart entre enseignants: 0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation: score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

The liver is the largest solid organ in the body and is critical for metabolic and immune functions. However, little is known about the cells that make up the human liver and its immune microenvironment. Here we report a map of the cellular landscape of the human liver using single-cell RNA sequencing. We provide the transcriptional profiles of 8444 parenchymal and non-parenchymal cells obtained from the fractionation of fresh hepatic tissue from five human livers. Using gene expression patterns, flow cytometry, and immunohistochemical examinations, we identify 20 discrete cell populations of hepatocytes, endothelial cells, cholangiocytes, hepatic stellate cells, B cells, conventional and non-conventional T cells, NK-like cells, and distinct intrahepatic monocyte/macrophage populations. Together, our study presents a comprehensive view of the human liver at single-cell resolution that outlines the characteristics of resident cells in the liver, and in particular provides a map of the human hepatic immune microenvironment.

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La notice

Revue: Nature Communications
Thématique: Single-cell and spatial transcriptomics
Domaine: Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens: Hospital for Sick ChildrenPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkToronto General HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnaires: National Institute of General Medical SciencesNational Institutes of HealthCanada First Research Excellence FundUniversiteit GentUniversity of TorontoUniversity of Washington
Mots-clés: Hepatic stellate cellImmune systemBiologyFlow cytometryCellLiver cytologyParenchymaCell typeMacrophageRNAMonocytePathologyCell biologyImmunologyGeneMedicineIn vitroGeneticsEndocrinology
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