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Enregistrement W2896626889 · doi:10.1038/s41416-018-0274-8

Candidate biomarkers of PARP inhibitor sensitivity in ovarian cancer beyond the BRCA genes

2018· article· en· W2896626889 sur OpenAlexaff
Darren Hodgson, Brian Dougherty, Zhongwu Lai, Anitra Fielding, Lynda Grinsted, Stuart Spencer, Mark J. O’Connor, Tony W. Ho, Jane Robertson, Jerry S. Lanchbury, Kirsten M. Timms, Alexander Gutin, Maria Orr, Helen Jones, C. Blake Gilks, Chris Womack, Charlie Gourley, Jonathan A. Ledermann, J. Carl Barrett

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Cancer · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNuCanaMyriad GeneticsAstraZeneca
Mots-clésOlaparibPARP inhibitorOvarian cancerMedicineBRCA mutationOncologyCancerInternal medicineCancer researchPopulationBiologyGeneticsGenePoly ADP ribose polymerasePolymerase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Olaparib (Lynparza™) is a PARP inhibitor approved for advanced BRCA -mutated ( BRCA m) ovarian cancer. PARP inhibitors may benefit patients whose tumours are dysfunctional in DNA repair mechanisms unrelated to BRCA1/2 . We report exploratory analyses, including the long-term outcome of candidate biomarkers of sensitivity to olaparib in BRCA wild-type ( BRCA wt) tumours. Tumour samples from an olaparib maintenance monotherapy trial (Study 19, D0810C00019; NCT00753545) were analysed. Analyses included classification of mutations in genes involved in homologous recombination repair (HRR), BRCA1 promoter methylation status, measurement of BRCA1 protein and Myriad HRD score. Patients with BRCA m tumours gained most benefit from olaparib; a similar treatment benefit was also observed in 21/95 patients whose tumours were BRCA wt but had loss-of-function HRR mutations compared to patients with no detectable HRR mutations (58/95). A higher median Myriad MyChoice ® HRD score was observed in BRCA m and BRCA wt tumours with BRCA1 methylation. Patients without BRCA m tumours derived benefit from olaparib treatment vs placebo although to a lesser extent than BRCA m patients. Ovarian cancer patients with tumours harbouring loss-of-function mutations in HRR genes other than BRCA1 / 2 may constitute a small, molecularly identifiable and clinically relevant population who derive treatment benefit from olaparib similar to patients with BRCA m.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations232
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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