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Enregistrement W2896722618 · doi:10.1002/ajb2.1162

Effects of glaciation and whole genome duplication on the distribution of the <i>Campanula rotundifolia</i> polyploid complex

2018· article· en· W2896722618 sur OpenAlexfundno aff
Brittany L. Sutherland, Laura F. Galloway

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Botany · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSociety for the Study of EvolutionMichigan Department of Natural ResourcesNatural EnglandMinistry of Natural ResourcesNational Science Foundation
Mots-clésBiologyGlacial periodPolyploidDisjunct distributionRange (aeronautics)Evolutionary biologyRefugium (fishkeeping)PleistocenePlant evolutionBiogeographyEcologyPhylogeographyGenomePhylogeneticsPaleontologyGeneticsPhylogenetic treeHabitat

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PREMISE OF THE STUDY: Both intrinsic and extrinsic factors contribute to a species distribution. Among plants, the extrinsic effects of glaciation and intrinsic effects of whole genome duplication are powerful drivers of biogeographical patterns, but the interplay of these factors is poorly understood. Here, we investigate the roles glaciation and whole-genome duplication have played in the evolution of the widespread polyploid complex Campanula rotundifolia. METHODS: We assessed the cytotype of 37 populations that spanned the geographic and cytotypic range of the C. rotundifolia complex. We constructed a chloroplast phylogeny for these populations and used RAD-seq to create nuclear phylogenies and networks for a subset of 23 populations; and estimated divergence times of major clades using Bayesian estimation of substitution rates. KEY RESULTS: Campanula rotundifolia originated in south-central Europe and underwent range expansion throughout much of Europe and North America. Multiple genome duplications have occurred in C. rotundifolia-at least two tetraploid and three hexaploid formations. CONCLUSIONS: Nuclear and chloroplast phylogenies are largely congruent with a history of populations surviving glacial maxima in known Pleistocene refugia in Europe and North America. Divergent European clades are consistent with two disjunct glacial refugia within Europe. North America was colonized by hexaploids derived from Western European lineages. A glacial refugium in Midwestern North America likely facilitated post-glacial recolonization of North America and limited genetic divergence. These results implicate both glaciation and whole-genome duplication as contributing factors to the extant biogeography of C. rotundifolia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,970
Score d'incertitude au seuil0,100

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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