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Enregistrement W2896799578 · doi:10.1002/humu.23621

Genetic database software as medical devices

2018· article· en· W2896799578 sur OpenAlexafffundabout
Adrian Thorogood, Seydina B. Touré, Johan Ordish, Alison Hall, Bartha Maria Knoppers

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBiomedical Ethics and Regulation
Établissements canadiensMcGill UniversityOntario Genomics
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of CanadaGénome QuébecMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationGenome Canada
Mots-clésSoftwareMedical softwareContext (archaeology)HarmComputer scienceData scienceSoftware developmentRisk analysis (engineering)BiologySoftware constructionMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This article provides a primer on medical device regulations in the United States, Europe, and Canada. Software tools are being developed and shared globally to enhance the accessibility and usefulness of genomic databases. Interactive software tools, such as email or mobile alert systems providing variant classification updates, are opportunities to democratize access to genomic data beyond laboratories and clinicians. Uncertainty over the reliability of outputs, however, raises concerns about potential harms to patients, especially where software is accessible to lay users. Developers may also need to contend with unfamiliar medical device regulations. The application of regulatory controls to genomic software could improve patient and user safety, but could also stifle innovation. Legal uncertainty for developers is compounded where software applications are made available globally (implicating multiple regulatory frameworks), and directly to lay users. Moreover, there is considerable uncertainty over the application of (evolving) medical device regulations in the context of both software and genetics. In this article, criteria and examples are provided to inform determinations of software as medical devices, as well as risk classification. We conclude with strategies for using genomic communication and interpretation software to maximize the availability and usefulness of genetic information, while mitigating the risk of harm to users.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,038
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,098
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,962
Score d'incertitude au seuil0,200

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0380,098
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0060,004
Études des sciences et des technologies0,0040,021
Communication savante0,0190,013
Science ouverte0,0040,008
Intégrité de la recherche0,0110,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,365
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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