Results from the Canadian Nosocomial Infection Surveillance Program for detection of carbapenemase-producing<i>Acinetobacter</i>spp. in Canadian hospitals, 2010–16
Notice bibliographique
Résumé
Objectives: Globally there is an increased prevalence of carbapenem-resistant Acinetobacter spp. (CRAs) and carbapenemase-producing Acinetobacter spp. (CPAs) in the hospital setting. This increase prompted the Canadian Nosocomial Infection Surveillance Program (CNISP) to conduct surveillance of CRA colonizations and infections identified from patients in CNISP-participating hospitals between 2010 and 2016. Methods: Participating acute care facilities across Canada submitted CRAs from 1 January 2010 to 31 December 2016. Patient data were collected from medical records using a standardized questionnaire. WGS was conducted on all CRAs and data underwent single nucleotide variant analysis, resistance gene detection and MLST. Results: The 7 year incidence rate of CRA was 0.02 per 10 000 patient days and 0.015 per 1000 admissions, with no significant increase observed over the surveillance period (P > 0.73). Ninety-four CRA isolates were collected from 58 hospitals, of which 93 (98.9%) were CPA. Carbapenemase OXA-235 group (48.4%) was the most common due to two separate clusters, followed by the OXA-23 group (41.9%). Patients with a travel history were associated with 38.8% of CRA cases. The all-cause 30 day mortality rate for infected cases was 24.4 per 100 CRA cases. Colistin was the most active antimicrobial agent (95.8% susceptibility). Conclusions: CRA remains uncommon in Canadian hospitals and the incidence did not increase from 2010 to 2016. Almost half of the cases were from two clusters harbouring OXA-235-group enzymes. Previous medical treatment during travel outside of Canada was common.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».