Semivariogram and Semimadogram functions as descriptors for AMD diagnosis on SD-OCT topographic maps using Support Vector Machine
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Age-related macular degeneration (AMD) is a degenerative ocular disease that develops by the formation of drusen in the macula region leading to blindness. This condition can be detected automatically by automated image processing techniques applied in spectral domain optical coherence tomography (SD-OCT) volumes. The most common approach is the individualized analysis of each slice (B-Scan) of the SD-OCT volumes. However, it ends up losing the correlation between pixels of neighboring slices. The retina representation by topographic maps reveals the similarity of these structures with geographic relief maps, which can be represented by geostatistical descriptors. In this paper, we present a methodology based on geostatistical functions for the automatic diagnosis of AMD in SD-OCT. METHODS: The proposed methodology is based on the construction of a topographic map of the macular region. Over the topographic map, we compute geostatistical features using semivariogram and semimadogram functions as texture descriptors. The extracted descriptors are then used as input for a Support Vector Machine classifier. RESULTS: For training of the classifier and tests, a database composed of 384 OCT exams (269 volumes of eyes exhibiting AMD and 115 control volumes) with layers segmented and validated by specialists were used. The best classification model, validated with cross-validation k-fold, achieved an accuracy of 95.2% and an AUROC of 0.989. CONCLUSION: The presented methodology exclusively uses geostatistical descriptors for the diagnosis of AMD in SD-OCT images of the macular region. The results are promising and the methodology is competitive considering previous results published in literature.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».