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Enregistrement W2897158445 · doi:10.1186/s12938-018-0592-3

Semivariogram and Semimadogram functions as descriptors for AMD diagnosis on SD-OCT topographic maps using Support Vector Machine

2018· article· en· W2897158445 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBioMedical Engineering OnLine · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRetinal Imaging and Analysis
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesUniversidade Federal do MaranhãoFundação de Amparo à Pesquisa e ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do MaranhãoConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Mots-clésVariogramSupport vector machineArtificial intelligencePattern recognition (psychology)Computer scienceGeostatisticsRemote sensingGeologyMathematicsMachine learningKrigingStatisticsSpatial variability

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Age-related macular degeneration (AMD) is a degenerative ocular disease that develops by the formation of drusen in the macula region leading to blindness. This condition can be detected automatically by automated image processing techniques applied in spectral domain optical coherence tomography (SD-OCT) volumes. The most common approach is the individualized analysis of each slice (B-Scan) of the SD-OCT volumes. However, it ends up losing the correlation between pixels of neighboring slices. The retina representation by topographic maps reveals the similarity of these structures with geographic relief maps, which can be represented by geostatistical descriptors. In this paper, we present a methodology based on geostatistical functions for the automatic diagnosis of AMD in SD-OCT. METHODS: The proposed methodology is based on the construction of a topographic map of the macular region. Over the topographic map, we compute geostatistical features using semivariogram and semimadogram functions as texture descriptors. The extracted descriptors are then used as input for a Support Vector Machine classifier. RESULTS: For training of the classifier and tests, a database composed of 384 OCT exams (269 volumes of eyes exhibiting AMD and 115 control volumes) with layers segmented and validated by specialists were used. The best classification model, validated with cross-validation k-fold, achieved an accuracy of 95.2% and an AUROC of 0.989. CONCLUSION: The presented methodology exclusively uses geostatistical descriptors for the diagnosis of AMD in SD-OCT images of the macular region. The results are promising and the methodology is competitive considering previous results published in literature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,569
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle