Perfection of eccentricity: Mitochondrial genomes of diplonemids
Notice bibliographique
Résumé
Mitochondria are the sandbox of evolution as exemplified most particularly by the diplonemids, a group of marine microeukaryotes. These protists are uniquely characterized by their highly multipartite mitochondrial genome and systematically fragmented genes whose pieces are spread out over several dozens of chromosomes. The type species Diplonema papillatum was the first member of this group in which the expression of fragmented mitochondrial genes was investigated experimentally. We now know that gene expression involves separate transcription of gene pieces (modules), RNA editing of module transcripts, and module joining to mature mRNAs and rRNAs. The mechanism of cognate module recognition and ligation is distinct from known intron splicing and remains to be uncovered. Here, we review the current status of research on mitochondrial genome architecture, as well as gene complement, structure, and expression modes in diplonemids. Further, we discuss the potential molecular mechanisms of posttranscriptional processing, and finally reflect on the evolutionary trajectories and trends of mtDNA evolution as seen in this protist group. © 2018 IUBMB Life, 70(12):1197-1206, 2018.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».