A simple and inexpensive method for practical storage of field-sample proteins for subsequent MALDI-TOF MS analysis
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Protein-containing samples can readily be characterised and/or identified using matrix-assisted laser-desorption and ionisation time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). This technique however requires relatively-fresh biological material that contains proteins that have not yet undergone significant degradation. For field-work collection of samples, problems are often encountered due to delays between collection and sample processing, sample storage (possibly at elevated temperature and/or humidity in some climates), quarantine/regulatory restrictions on the transfer of living biological materials across national borders, and the potential to transfer unwanted microorganisms via non-living biological materials. In an attempt to overcome the above difficulties, we have developed a simple and inexpensive method for practical storage of field-sample proteins, for subsequent MALDI-TOF MS analysis, in which biological material is crushed onto filter paper and dried. The dried and protein-impregnated filter paper can then be soaked in an alcoholic solution suitable for the inactivation of microorganisms of concern and again dried for storage. After subsequent dry storage, the proteins may be eluted from the paper using a solution containing acetonitrile, trifluoroacetic acid, water, and MALDI-TOF MS matrix near to saturation. The extracted proteins are then pipetted onto the MALDI-TOF MS sample plate for subsequent analysis. Using this method, spectra of comparable quality to fresh-material controls have been obtained for acid-soluble proteins from Fallopia japonica and Impatiens glandulifera leaf material. Unlike untreated leaf material, high-quality spectra can be obtained with and without alcohol treatment even after storage for one month at up to 40 °C. We have developed a simple and inexpensive method for practical storage of field-sample proteins for subsequent MALDI-TOF MS analysis. Key benefits of this approach are a reduction in sample degradation, and consequent conservation of taxon-discriminatory spectral profiles, whilst minimising the potential for carryover of viable microorganisms.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle